E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



Laboratoř vývojové biologie

Vedoucí: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D., RNDr. Tereza Tlapáková, Ph.D.

V explozivně se rozvíjejícím oboru se laboratoř zaměřila na genetický a genomický přístup k embryologii u Xenopus laevis a Xenopus tropicalis. Ve spolupráci s University of Houston USA se zabývá mapováním genomu nového modelového organismu pro embryologii X. tropicalis.

Hlavními technikami je vizualizace genů na chromosomech, laserová mikrodisekce chromosomů a mikroinjekce do embryí. V poslední době se v laboratoři podařila izolace kmenových buněk z tkáňové kultury, což představuje do budoucna možnost přípravy knock-out jedinců a studium diferenciačních procesů. V neposlední řadě výsledky mapování genomu umožnily i evoluční přístup a analýzu evoluce savčího X chromosomu.

 

Laboratoř: Viničná 7, přízemí, č. dv. 40

Vedoucí skupiny:

Krylov Vladimír (Ing. RNDr., Ph.D.) - vedoucí skupiny
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; vkrylov@natur.cuni.cz

Tlapáková Tereza (RNDr.,Ph.D)
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; tereza.tlapakova@natur.cuni.cz

Postdoci:

Knytl Martin (Ing., Ph.D.)
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; martin.knytl@natur.cuni.cz

Doktorandi:

Mančíková Andrea (Mgr.)
Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, andrea.mancikova@email.cz

Vávra Jiří (Ing. Mgr.)
Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, vavraji4@seznam.cz

Vegrichtová Markéta (Mgr.)
Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, marketa.vegrichtova@natur.cuni.cz

 

Magisterští studenti:

Červenková Michaela (Bc.) - Email: luci.slovakova@seznam.cz

Onhajzr Jakub (Bc.) - Email: jakub.onhajzer20@gmail.com

Slováková Lucie (Bc.) - Email: luci.slovakova@seznam.cz

Wróblová Aneta (Bc.) - Email: aneta.wroblova@gmail.com

 

Technici:

Vávra Jiří (Ing. Mgr.) - Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, vavraji4@seznam.cz

 

Publikace 2019:

Nguyen TXM, Vegrichtova M, Tlapakova T, Krulova M, Krylov V. (2019) Epithelial-Mesenchymal Transition Promotes the Differentiation Potential of Xenopus tropicalis Immature Sertoli Cells. Stem Cells Int 5, 8387478 (IF 3.989).

Nguyen TXM, Vegrichtova M, Tlapakova T, Krulova M, Krylov V. (2019) The interconnection between cytokeratin and cell membrane-bound β-catenin in Sertoli cells derived from juvenile Xenopus tropicalis testes. Biology open, submitted (IF 2.217).

Stiburkova B, Bohata J, Minarikova I, Mancikova A, Vavra J, Krylov V, Doležel Z. (2019) Clinical and Functional Characterization of a Novel URAT1 Dysfunctional Variant in a Pediatric Patient with Renal Hypouricemia. Appl Sci 9, 3479 (IF 2,217).

Toyoda Y, Mančíková A, Krylov V, Morimoto K, Pavelcová K, Bohatá J, Pavelka K, Pavlíková M, Suzuki H, Matsuo H, Takada T, Stiburkova B. (2019) Functional Characterization of Clinically-Relevant Rare Variants in ABCG2 Identified in a Gout and Hyperuricemia Cohort. Cells 8(4) (IF 4.829)

Seroussi E, Knytl M, Pitel F, Elleder D, Krylov V, Leroux S, Morisson M, Yosefi S, Miyara S, Ganesan S, Ruzal M, Andersson L, Friedman-Einat M. (2019) Avian Expression Patterns and Genomic Mapping Implicate Leptin in Digestion and TNF Signaling, Suggesting that Their Interacting Adipokine Role is Unique to Mammals. Int J Mol Sci 20, 4489 (IF = 4,183).

Petelak A., Krylov V. (2019) Surface sperm cell ubiquitination directly impaired blastocyst formation rate after intracytoplasmic sperm injection in pig. Theriogenology 135, 115-120 (IF 2.136).

Targueta CP, Krylov V, Nondilo TE, Lima J,  Lourenço LB. Sex chromosome evolution in frogs – helpful insights from chromosome painting in the genus Engystomops. Heredity, submitted. (IF 3.872).

 

Publikace 2018:

Knytl M, Tlapakova T, Vankova T, Krylov V. (2018) Silurana chromosomal evolution: A new piece to the puzzle. Cytogenet Genome Res 156, 223-228 (IF 1.587).

Knytl M, Kalous L, Rylková K, Choleva L, Merilä J, Ráb P. (2018) Morphologically indistinguishable hybrid Carassius female with 156 chromosomes: A threat for the threatened crucian carp, C. carassius, L. PLoS One 13, e0190924 (IF 2.766).

 

Publikace (2013-2007)

Seifertova E, Zimmerman LB, Gilchrist MJ, Macha J, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Owens ND, Sesay AK, Tlapakova T, Krylov V. (2013) Efficient high-throughput sequencing of a laser microdissected chromosome arm. BMC Genomics. 2013 May 28;14(1):357. (IF 4,397).

Bewick AJ, Chain FJ, Zimmerman LB, Sesay A, Gilchrist MJ, Owens ND, Seifertova E, Krylov V, Macha J, Tlapakova T, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Evans BJ. (2013) A large pseudoautosomal region on the sex chromosomes of the frog Silurana tropicalis., Genome Biol Evol., in Press.

Flajnik MF, Tlapakova T , Criscitiello MF, Krylov V, Ohta Y. (2012) Evolution of the B7 family: co-evolution of B7H6 and NKp30, identification of a new B7 family member, B7H7, and of B7's historical relationship with the MHC.

Mácha JTeichmanová R, Sater AK, Wells DE, Tlapáková T, Zimmerman LB, Krylov V. (2012) Deep ancestry of mammalian X chromosome revealed by comparison with the basal tetrapod Xenopus tropicalis. BMC Genomics 13:315. (IF=4.073)

 

Sanchez-Ramos I,Cross I,Mácha J, Martínez-Rodríguez,Krylov V,Rebordinos L. (2012) Assessment of Tools for Marker-Assisted Selection in a Marine Commercial Species: Significant Association between MSTN-1 Gene Polymorphism and Growth Traits. The ScientificWorld Journal, Volume 2012, Article ID 369802, 10 pages, doi:10.1100/2012/369802. (Impact factor coming in 2013)

 

Vackova I, Novakova Z, Krylov V, Okada K, Kott T, Fulka H, Motlik J. (2011) Analysis of Marker Expression in Porcine Cell Lines Derived from Blastocysts Produced In Vitro and In Vivo. J Reprod Dev. 57(5):594-603. (bez afiliace)

 

Wells DE, Gutierrez L, Xu Z, Krylov V, Mácha J, Blankenburg KP, Hitchens M, Bellot L, Spivey M, Kowis A, Ye Y, Pasternak S, Owen J, Tran T, Slavíková R, Tůmová L, Tlapáková T, Seifertová E,Scherer SE, Sater AK (2011) A genetic map of Xenopus tropicalis. Dev Biol. 354(1): 1-8. (IF 4.379)

Zubáčová Z, Krylov V, Tachezy J. (2011) Fluorescence in situ hybridization (FISH) mapping of single copy genes on Trichomonas vaginalis chromosomes. Mol Biochem Parasitol. 176(2):135-137. (IF 2.875)

Krylov V, Kubíčková S, Rubeš J, Mácha J, Tlapáková T, Seifertová E, Šebková N (2010) Preparation of Xenopus tropicalis whole chromosome painting probes using laser microdissection and reconstruction of X. laevis tetraploid karyotype by Zoo-FISH. Chromosome Res18(4): 431-439. (IF 3.230)

Khokha M.K., Krylov V., Reilly M.J., Gall J.G., Bhattacharya D., Cheung C.Y., Kaufman S., Lam D.K., Macha J., Ngo C., Prakash N., Schmidt P., Tlapakova T., Trivedi T., Tumova L., Abu-Daya A., Geach T., Vendrell E., Ironfield H., Sinzelle L., Sater A.K., Wells D.E., Harland R.M., Zimmerman L.B. Rapid gynogenetic mapping of Xenopus tropicalis mutations to chromosomes. Dev Dyn. 2009; 238(6):1398-1346. (IF 2.833)

 

Zubáčová Z, Krylov V, Tachezy J. (2011) Fluorescence in situ hybridization (FISH) mapping of single copy genes on Trichomonas vaginalis chromosomes. Mol Biochem Parasitol. 176(2):135-137. (IF 2.875)

Krylov V, Kubíčková S, Rubeš J, Mácha J, Tlapáková T, Seifertová E, Šebková N (2010) Preparation of Xenopus tropicalis whole chromosome painting probes using laser microdissection and reconstruction of X. laevis tetraploid karyotype by Zoo-FISH. Chromosome Res18(4): 431-439. (IF 3.230)

Khokha MK, Krylov V, Reilly MJ, Gall JG, Bhattacharya D, Cheung CY, Kaufman S, Lam DK, Mácha J, Ngo C, Prakash N, Schmidt P, Tlapáková T, Trivedi T, Tůmová L, Abu-Daya A, Geach T, Vendrell E, Ironfield H, Sinzelle L, Sater AK, Wells DE, Harland RM, Zimmerman LB (2009) Rapid gynogenetic mapping of Xenopus tropicalis mutations to chromosomes. Dev Dyn. 238(6):1398-46. (IF 2.864)

Krylov V, Tlapáková T, Mácha J, Curlej J, Ryban L, Chrenek P (2008) Localization of human coagulation factor VIII (hFVIII) in transgenic rabbit by FISH-TSA: identification of transgene copy number and transmission to the next generation. Folia Biol (Praha) 54(4):121-4. (IF 0.729)

Krylov V, Tlapakova T, Mácha J. (2007) Localization of the single copy gene Mdh2 on Xenopus tropicalis chromosomes by FISH-TSA.(IF 1.783)

 

Akce dokumentů