E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



Laboratoř vývojové biologie

Vedoucí: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D., RNDr. Tereza Tlapáková, Ph.D.

V explozivně se rozvíjejícím oboru se laboratoř zaměřila na genetický a genomický přístup k embryologii u Xenopus laevis a Xenopus tropicalis. Ve spolupráci s University of Houston USA se zabývá mapováním genomu nového modelového organismu pro embryologii X. tropicalis.

Hlavními technikami je vizualizace genů na chromosomech, laserová mikrodisekce chromosomů a mikroinjekce do embryí. V poslední době se v laboratoři podařila izolace kmenových buněk z tkáňové kultury, což představuje do budoucna možnost přípravy knock-out jedinců a studium diferenciačních procesů. V neposlední řadě výsledky mapování genomu umožnily i evoluční přístup a analýzu evoluce savčího X chromosomu.

 

Vedoucí skupiny:

Krylov Vladimír (Ing.RNDr.,Ph.D.) - vedoucí skupiny
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; krylov@natur.cuni.cz

Tlapáková Tereza (RNDr.,Ph.D)
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; ttlapka@natur.cuni.cz

Postdoci:

ing.. Martin Knytl, Ph.D.

Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1773; martin.knytl@natur.cuni.cz

Doktorandi:

Flachsová roz. Šídová Monika (Mgr.)
Kontaktní údaje: V7/P45; +420 22195 1773; monca-sidova@seznam.cz
Rok zahájení: 2010/11; Školitel: RNDr. Tereza Tlapáková, Ph.D.

Mančíková Andrea (Mgr..)

Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, andrea.mancikova@email.cz
Rok zahájení: 2013/2014, Školitel: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D.

Petelák Aleš (Bc.)
Kontaktní údaje: V7/P40; +420 22195 1782; petelak.ales@gmail.com
Rok zahájení: 2011/12, Školitel: Ing.RNDr. Vladimír Krylov, CSc.

Xuan Nguyen (Mgr.)

Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, ntmxuanbk@gmail.com
Rok zahájení: 2013/2014, Školitel: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D.

 

Magisterští studenti:

Bláhová Monika (Bc.)

Kontaktní údaje:V7/P45, +420 22195 1798, gembino@seznam.cz
Rok zahájení: 2013/14, Školitel: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D.

 

Smolík Ondřej (Bc.)

Kontaktní údaje: V7/P45; +420 22195 1798; ondrej.smolik@natur.cuni.cz
Rok zahájení: 2014/15, Školitel: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D.

Strnadová Karolína (Bc.)

Kontaktní údaje: V7/P45, +420 22195 1798, karolina.strnadova5@gmail.com
Rok zahájení: 2013/14, Školitel: RNDr. Tereza Tlapáková, Ph.D.

 

Kroumanová Kristýna (Bc.)

Kontaktní údaje: V7/S017; +420 22195 1782,  kroumanova.kristyna@seznam.cz
Rok zahájení: 2014/15; Školitel: Ing. RNDr. Vladimír Krylov, Ph.D.

 

 

Technici:

Tereza Kratochvílová

Kontaktní údaje: V7/40; +420 22195 1798; Tereza.kratochvilova1@natur.cuni.cz

 

 

Laboratoř: Viničná 7, přízemí, č. dv. 40

 

Publikace (2013-2007)

Seifertova E, Zimmerman LB, Gilchrist MJ, Macha J, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Owens ND, Sesay AK, Tlapakova T, Krylov V. (2013) Efficient high-throughput sequencing of a laser microdissected chromosome arm. BMC Genomics. 2013 May 28;14(1):357. (IF 4,397).

Bewick AJ, Chain FJ, Zimmerman LB, Sesay A, Gilchrist MJ, Owens ND, Seifertova E, Krylov V, Macha J, Tlapakova T, Kubickova S, Cernohorska H, Zarsky V, Evans BJ. (2013) A large pseudoautosomal region on the sex chromosomes of the frog Silurana tropicalis., Genome Biol Evol., in Press.

Flajnik MF, Tlapakova T , Criscitiello MF, Krylov V, Ohta Y. (2012) Evolution of the B7 family: co-evolution of B7H6 and NKp30, identification of a new B7 family member, B7H7, and of B7's historical relationship with the MHC.

Mácha JTeichmanová R, Sater AK, Wells DE, Tlapáková T, Zimmerman LB, Krylov V. (2012) Deep ancestry of mammalian X chromosome revealed by comparison with the basal tetrapod Xenopus tropicalis. BMC Genomics 13:315. (IF=4.073)

 

Sanchez-Ramos I,Cross I,Mácha J, Martínez-Rodríguez,Krylov V,Rebordinos L. (2012) Assessment of Tools for Marker-Assisted Selection in a Marine Commercial Species: Significant Association between MSTN-1 Gene Polymorphism and Growth Traits. The ScientificWorld Journal, Volume 2012, Article ID 369802, 10 pages, doi:10.1100/2012/369802. (Impact factor coming in 2013)

 

Vackova I, Novakova Z, Krylov V, Okada K, Kott T, Fulka H, Motlik J. (2011) Analysis of Marker Expression in Porcine Cell Lines Derived from Blastocysts Produced In Vitro and In Vivo. J Reprod Dev. 57(5):594-603. (bez afiliace)

 

Wells DE, Gutierrez L, Xu Z, Krylov V, Mácha J, Blankenburg KP, Hitchens M, Bellot L, Spivey M, Kowis A, Ye Y, Pasternak S, Owen J, Tran T, Slavíková R, Tůmová L, Tlapáková T, Seifertová E,Scherer SE, Sater AK (2011) A genetic map of Xenopus tropicalis. Dev Biol. 354(1): 1-8. (IF 4.379)

Zubáčová Z, Krylov V, Tachezy J. (2011) Fluorescence in situ hybridization (FISH) mapping of single copy genes on Trichomonas vaginalis chromosomes. Mol Biochem Parasitol. 176(2):135-137. (IF 2.875)

Krylov V, Kubíčková S, Rubeš J, Mácha J, Tlapáková T, Seifertová E, Šebková N (2010) Preparation of Xenopus tropicalis whole chromosome painting probes using laser microdissection and reconstruction of X. laevis tetraploid karyotype by Zoo-FISH. Chromosome Res18(4): 431-439. (IF 3.230)

Khokha M.K., Krylov V., Reilly M.J., Gall J.G., Bhattacharya D., Cheung C.Y., Kaufman S., Lam D.K., Macha J., Ngo C., Prakash N., Schmidt P., Tlapakova T., Trivedi T., Tumova L., Abu-Daya A., Geach T., Vendrell E., Ironfield H., Sinzelle L., Sater A.K., Wells D.E., Harland R.M., Zimmerman L.B. Rapid gynogenetic mapping of Xenopus tropicalis mutations to chromosomes. Dev Dyn. 2009; 238(6):1398-1346. (IF 2.833)

 

Zubáčová Z, Krylov V, Tachezy J. (2011) Fluorescence in situ hybridization (FISH) mapping of single copy genes on Trichomonas vaginalis chromosomes. Mol Biochem Parasitol. 176(2):135-137. (IF 2.875)

Krylov V, Kubíčková S, Rubeš J, Mácha J, Tlapáková T, Seifertová E, Šebková N (2010) Preparation of Xenopus tropicalis whole chromosome painting probes using laser microdissection and reconstruction of X. laevis tetraploid karyotype by Zoo-FISH. Chromosome Res18(4): 431-439. (IF 3.230)

Khokha MK, Krylov V, Reilly MJ, Gall JG, Bhattacharya D, Cheung CY, Kaufman S, Lam DK, Mácha J, Ngo C, Prakash N, Schmidt P, Tlapáková T, Trivedi T, Tůmová L, Abu-Daya A, Geach T, Vendrell E, Ironfield H, Sinzelle L, Sater AK, Wells DE, Harland RM, Zimmerman LB (2009) Rapid gynogenetic mapping of Xenopus tropicalis mutations to chromosomes. Dev Dyn. 238(6):1398-46. (IF 2.864)

Krylov V, Tlapáková T, Mácha J, Curlej J, Ryban L, Chrenek P (2008) Localization of human coagulation factor VIII (hFVIII) in transgenic rabbit by FISH-TSA: identification of transgene copy number and transmission to the next generation. Folia Biol (Praha) 54(4):121-4. (IF 0.729)

Krylov V, Tlapakova T, Mácha J. (2007) Localization of the single copy gene Mdh2 on Xenopus tropicalis chromosomes by FISH-TSA.(IF 1.783)

 

Akce dokumentů