Podmínky využití laboratoře a režim práce

• máte určitý objem financí na plánované analýzy (nejlépe nějaké grantové prostředky)
• víte jakou metodiku chcete aplikovat - metodiky popsané na tomto webu víceméně spolehlivě fungují (nic však není garantováno, s některými druhy je prostě občas problém), zavedení jakýchkoliv dalších postupů nebo modifikací je rozhodně možné
• absolvovali jste DNA praktikum nebo se necháte zaučit, tj. analýzy si děláte sami s možností konzultace
• předem se dohodnete na termínu, kdy budete analýzy provádět
• budete respektovat základní bezpečnostní pravidla a zavedené zvyky používání společných chemikálií a spotřebního materiálu
• souhlasíte s cenou za prováděné analýzy (viz Ceník analýz) a budete si pravidelně vést evidenci provedených analýz do tabulky, která bude uložena v laboratoři
• za provedené analýzy se platí nejlépe předem a to formou různých faktur za spotřební materiál a chemikálie, které dostanete k proplacení z vašeho grantu

Několik poznámek k sekvenování a fragmentační analýze

• sekvenace DNA a fragmentační analýza je prováděna v Sekvenační laboratoři biologické sekce PřF UK, vzorky se odnášejí hromadně
• zkumavky s přesráženými sekvencemi (nebo AFLP či mikrosatelitovými reakcemi) očíslujte po dohodě s Veronikou a na průvodní list napište názvy vzorků, použité sekvenační primery, případně kombinace AFLP primerů
• vzorky na sekvenování se odnášejí zpravidla 1 týdně, někdy i častěji
• fragmentační analýza je prováděna po dohodě (dle zájmu až 1´ týdně)
• analyzované vzorky jsou uloženy na FTP serveru katedry botaniky (hostitel: botany.natur.cuni.cz, uživatel: sequences, heslo: ************), přístup např. přes Total Commander (konfigurace), v adresáři sekvence a fragmentace jsou vzorky uloženy v adresářích podle data analýzy na sekvenátoru (ve formátu rr-mm-dd), je také přiložen PDF soubor se seznamem vzorků