Přístrojové vybavení a připravenost pracoviště

Katedry biologické sekce zapojené do navrhované projektu disponují kvalitním zázemím umožňujícím využití nejmodernějších přístupů pro výzkum diverzity nejrůznějších skupin organismů, od jednobuněčných organismů (řasy, prvoci) po vyšší rostliny a živočichy. Kromě vybavení pro terénní práci, jež je při studiu biodiverzity nezbytné (včetně dvou terénních vozů s náhonem 4x4, nafukovacího člunu s přívěsným motorem, zařízení pro odběr vzorků pro paleoekologické studie v terestrickém i vodním prostředí, multisondy pro automatizované měření fyzikálních a chemických parametrů vody apod.) jsou k dispozici molekulární laboratoře vybavené pro detailní analýzy DNA i proteinů, mikroskopovací pracoviště vybavená kvalitní optikou pro rutinní práci a další specializované laboratoře. Dále jsou k disposici dva velmi kvalitní cytometry pro studium ploidní úrovně i absolutní velikosti genomu. Neméně významnou infrastrukturou pro výzkum jsou herbářové sbírky a kultury mikroorganismů.

Dále jsou pro výzkum jednotlivých pracovních skupin intenzivně využívány společná servisní pracoviště sekce biologie PřF UK: laboratoř sekvenace DNA (umožňující sekvenaci i fragmentační analýzu), laboratoř elektronové mikroskopie (disponující rastrovacím i transmisním elektronovým mikroskopem), laboratoř konfokální a fluorescenční mikroskopie, genomická a proteomická laboratoř a laboratoř hmotnostní spektrometrie. U genomických metod se předpokládá provedení na zakázku u firem jako Roche, Pacific Biosciences aj., jak je u tohoto typu analýz obvyklé. V horizontu cca 3-4 let lze také předpokládat využití nově vybavované infrastruktury Biocentra a Globcentra v kampusu Albertov, jež dále posílí instrumentální zázemí pracovišť biologické sekce PřF UK.