E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



Výzkumné skupiny

V současné době existuje na katedře genetiky a mikrobiologie devět výzkumných skupin (viz dále) které se zabývají výzkumem v různých oblastech molekulární a buněčné biologie, genetiky, mikrobiologie a virologie. Členové čtyř z nich (Laboratoř virologie, Laboratoř imunoterapie, Laboratoř molekulární epidemiologie virů, Laboratoř biologie kvasinkových kolonií) jsou zároveň členy výzkumných projektů biotechnologického a biomedicínského centra AV ČR a UK v Praze BIOCEV (Vestec u Prahy), a to v rámci programu Buněčná biologie a virologie. Kromě toho je ke katedře v rámci BIOCEV částečně přičleněna i skupina Proteázy lidských patogenů (vedoucí v rámci katedry Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.), jejímž domovským pracovištěm je Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.

Členové jednotlivých laboratoří katedry výsledky svého výzkumu běžně publikují v prestižních vědeckých časopisech a monografiích a prezentují na mezinárodních i národních konferencích. Výzkumné projekty jsou podporovány mnoha domácími i zahraničními granty.

 

Virologie

V rámci Laboratoře virologie (vedoucí doc. RNDr. Jitka Forstová, CSc.) je výzkum orientován především na malé DNA viry z čeledi Polyomaviridae a Hepadnaviridae. Členové laboratoře studují interakce virů a jejich produktů s různými strukturami hostitelských buněk a funkční důsledky těchto interakcí. Zabývají se rovněž možnostmi využití virových kapsid a pseudokapsid v genové terapii a/nebo importu biologicky aktivních látek do savčích buněk. Skupina doc. RNDr. Ivana Hirsche, CSc., studuje v rámci této Laboratoře roli přirozené imunity při eliminaci genomu viru Hepatitidy B z jader infikovaných buněk. Tato skupina se rovněž dlouhodobě zabývá možností eradikace rezervoáru HIV rezistentního na léčbu kombinovanou terapií.

Laboratoř molekulární a nádorové virologie (vedoucí RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D.) se zabývá studiem malých neobalených DNA virů asociovaných s nádorovým onemocněním u člověka. Kromě studia lidských papilomavirů se skupina věnuje studiu lidských polyomavirů a jiných malých DNA virů (anellovirů, lidského bocaviru). Tento tým vyvinul i řadu přístupů k charakterizaci virové etiologie nádorů.

Laboratoř imunoterapie (vedoucí RNDr. Michal Šmahel. Ph.D.) se zabývá imunoterapií nádorů vyvolaných lidskými viry. Experimentální výzkum imunoterapeutických postupů probíhá na myších modelech nádorů způsobených lidskými papillomaviry. Jsou vyvíjeny DNA vakcíny namířené proti nádorovým antigenům i antigenům buněk podporujících růst nádorů. Aktivace adaptivní imunity DNA vakcinací je kombinována s aktivací buněk vrozené imunity a s utlumováním imunosupresivních mechanismů, které inhibují protinádorovou imunitu. Pozornost je také věnována snížené produkci molekul MHC 1. třídy na nádorových buňkách a přípravě odpovídajících myších modelů. Dále jsou z hlediska imunoterapie analyzovány vlastnosti myších i lidských nádorů.

Fyziologie bakterií

Laboratoř fyziologie bakterií (vedoucí RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.) se zabývá funkcí bakteriálních toxinů, které působí na cytoplazmatickou membránu cílové buňky. Dále se zabývá adaptací bakteriální membrány ke stresům a její interakcí s povrchově aktivními látkami a také interakcí bakteriálních buněk s nanomateriály. Skupina využívá kromě tradičních mikrobiologických přístupů také pestrou škálu biofyzikálních metod: metody založené na fluorescenční spektroskopii a mikroskopii, vodivostní měření na lipidových dvojvrstvách, rentgenostrukturní analýzu, metody analytické chemie (plynová a kapalinová chromatografie) a výpočetní metody pro stanovení struktur proteinů.

Genetika bakterií

Výzkumná problematika Laboratoře genetiky bakterií (vedoucí RNDr. Irena Lichá, CSc.) je zaměřena na regulaci obecné stresové odpovědi u modelové bakterie Bacillus subtilis a adaptivní mutagenezi v důsledku působení fyzikálních stresorů. Další tématikou, kterou se členové laboratoře zabývají, je studium fyziologických mechanizmů, které půdním bakteriím dovolují vyrovnávat se s účinky chemických látek kontaminujících v důsledku lidské činnosti půdní prostředí.

Biologie kvasinkových kolonií

Hlavními tématy výzkumu v Laboratoři biologie kvasinkových kolonií (vedoucí prof. RNDr. Zdena Palková, CSc.) jsou molekulární aspekty vývoje a extracelulární signalizace u kolonií kvasinek jakožto modelu mnohobuněčné organizované struktury. Mezi dva základní výzkumné směry patří studium rozdílů mezi mechanizmy tvorby kolonií v přírodních a laboratorních podmínkách, studium role amoniaku jako signální molekuly při dlouhodobém přežívání kolonií, a studium horizontální i vertikální diferenciace buněk kolonií, přičemž některé parametry této diferenciace souvisejí s přežíváním, resp. s programovanou buněčnou smrtí buněk ve specifických oblastech.

Tým pracovníků a studentů Laboratoře biochemie RNA (vedoucí RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D.) zkoumá základní principy syntézy bílkovin v eukaryotických buňkách. Cílem je pomocí vybraných modelů odhalit pravidla hry mezi viry a buněčnou protivirovou obranou, či použít získané poznatky základního výzkumu pro pochopení vzniku některých (zejména nádorových) onemocnění. Hlavními modely, které laboratoř využívá, jsou lidské buněčné linie, varianty viru žloutenky typu C a v neposlední řadě jednobuněčný modelový eukaryotický organismus – kvasinka Saccharomyces cerevisiae.

Genetika rostlin

Laboratoř genetiky rostlin (vedoucí RNDr. Dana Holá, Ph.D.) je dlouhodobě zaměřena na výzkum vnitrodruhové variability v různých funkčních a strukturních charakteristikách hospodářsky významných rostlin, především s ohledem na možné příčiny heterózního efektu. Členové laboratoře se v současnosti věnují zejména studiu příčin odlišné odolnosti inbredních a hybridních genotypů k různým abiotickým stresovým faktorům, a dále studiu působení brassinosteroidů a ekdysteroidů na rostlinný organizmus, zejména na fotosyntetický aparát. Spolupracují také s dalšími pracovišti PřF UK v Praze, ČZU v Praze a AV ČR v rámci výzkumu fotosyntetických charakteristik jehličnanů.

Cytogenetika pavoukovců

Laboratoř cytogenetiky pavoukovců (vedoucí doc. RNDr. Jiří Král, Ph.D.) je celosvětově jedinou laboratoří specializující se na chromozomální analýzy této skupiny členovců, která je velmi vhodným modelovým objektem např. pro studium evoluce pohlavních či holocentrických chromozómů, achiazmatické meiózy nebo polyploidizace živočišného genomu, jakož i modifikací karyotypu spojených s různými způsoby partenogeneze.

 

Přístrojové vybavení katedry umožňuje jejím členům a studentům rutinně používat nejrůznější běžné i specializovanější metodické přístupy a techniky z oblasti molekulární a buněčné biologie, genetiky, mikrobiologie i virologie. Členové katedry mohou své metodické i technické zkušenosti a zázemí po předchozí dohodě poskytnout i externím subjektům, ať již v rámci vědeckovýzkumné spolupráce nebo za specificky stanovených podmínek.

Akce dokumentů