Dlouhodobě se věnuji mapování povrchu buněk imunitního systému pomocí vazebných reagencií a zavádění nových způsobů jejich přípravy. Zajímám se o dynamické změny v imunitním systému při ohrožení homeostázy organismu v podmínkách infekčních chorob a vývoji nádorů. Oba tyto patologické projevy jsou úzce spojené s imunitním systémem ve fázi vzniku i ve fázi selekce vzácných případů únikových mutačních procesů, které jsou příčinou mnohem vážnějších patologií. Ty jsou spojené s delokalizací patogenů a nádorových buněk do dalších orgánů, které se vyznačují odlišným charakterem imunitní odpovědi. Nově se věnuji výpočetním metodám vizualizace velkých dat, nástrojům pro klastrování a redukci dinemzionality. Při objemu vědeckých dat, které moderní systémová biologie vytváří je tento přístup jediným možným způsobem jak objevovat nové biomarkery stavu zdraví a nemoci. Odkaz na laboratorní stránky: https://www.natur.cuni.cz/biologie/bunecna-biologie/pracovni-skupiny/Molekularni_dynamika_imunitni_odpovedi