Laboratoř sekvenace DNA
PORUCHA SEKVENÁTORU VE VINIČNÉ 18.4.-22.4.
Prosíme odložte zasílání vzorků na FRAGMENTACI.
PROGRAM GENEIOUS - platnost licencí Geneious byla prodloužena na další rok (do konce srpna 2024).
GENEIOUS PROGRAMME - Geneious licences have been extended for another year (until the end of August 2024).
PROGRAM GENEIOUS - Máme zakoupeno 25 licencí programu Geneious. Můžete si pravidelně stahovat vždy i tu nejnovější verzi. Noví uživatelé - pro přístupové údaje kontaktujte laboratoř seqlab()natur.cuni.cz. Licence fungují buď přímo z fakultních počítačů nebo přes vzdálený přístup z domova, o který si musíte zažádat na CIT.
AKTUALIZACE!!
Příjem vzorků na sekvenaci v laboratoři OMICS - Genomika probíhá standardně
v pondělí, ve středu a v pátek v 8 hodin.
The sequencing laboratory works in the usual way, the transfers take place again on Monday, Wednesday and Friday at 8:00.
Sběrná lednička ve Viničné
POZOR, od 11. 5. 2020 změna času převozu v pondělí !
Převoz vzorků z Viničné do Biocevu:
po - ráno = vzorky do 8.00
st - ráno = vzorky do 8.00
pá - ráno = vzorky do 8.00
ostatní dny - příležitostně
Vzorky můžete do lednice ukládat průběžně, buďte bez obav, i týden vydrží bez problémů.
Všechny SEKVENACE jsou zpracovávány v Biocevu. Vzorky dávejte do označené krabice v lednici a pro jistotu označte sáček SQ.
Fragmentační analýza zůstává na zpracování ve Viničné 7, stále na stejném přístroji. Vzorky dávejte do mrazáčkové poličky a pro jistotu označte sáček FR.
Pokud reakce neproběhla, něco je špatně. Neposílejte tytéž vzorky připravené stejným způsobem, nebude to lepší! Zkontrolujte na novém nanodropu čistotu (hl. u PCR fragmentů). Zkontrolujte, zda máme správné primery (hl. u plasmidů). Konzultujte nastalou situaci s námi a zašlete zvlášť DNA a primery. Koncentraci a čistotu DNA ještě přeměříme a případně DNA přečistíme a sami sekvenační reakci namícháme.
Prosíme dodržujte:
1 sample = 1 tube (0,2ul) = 1 row in sample sheet
DOPORUČENÍ PRO PŘÍPRAVU VZORKŮ NA SEKVENAČNÍ REAKCI.
KONCENTRACE: 5ng/100pb u PCR produktů a 3ng/100pb plasmidové DNA (započítává se celá délka plasmidu), odpovídá 100-200ng do reakce (max. 300ng u velkých plasmidů). Pokud vám sekvenace chodí dobře, koncentraci samozřejmě neměňte!
V sekci užitečné informace je nově část NEJČASTĚJŠÍ PROBLÉMY.
Stahujte si, prosím, aktuální průvodky.
Doručovací adresa:
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
GENEIOUS PROGRAMME - Geneious licences have been extended for another year (until the end of August 2024).
PROGRAM GENEIOUS - Máme zakoupeno 25 licencí programu Geneious. Můžete si pravidelně stahovat vždy i tu nejnovější verzi. Noví uživatelé - pro přístupové údaje kontaktujte laboratoř seqlab()natur.cuni.cz. Licence fungují buď přímo z fakultních počítačů nebo přes vzdálený přístup z domova, o který si musíte zažádat na CIT.
AKTUALIZACE!!
Příjem vzorků na sekvenaci v laboratoři OMICS - Genomika probíhá standardně
v pondělí, ve středu a v pátek v 8 hodin.
The sequencing laboratory works in the usual way, the transfers take place again on Monday, Wednesday and Friday at 8:00.
Sběrná lednička ve Viničné
POZOR, od 11. 5. 2020 změna času převozu v pondělí !
Převoz vzorků z Viničné do Biocevu:
po - ráno = vzorky do 8.00
st - ráno = vzorky do 8.00
pá - ráno = vzorky do 8.00
ostatní dny - příležitostně
Vzorky můžete do lednice ukládat průběžně, buďte bez obav, i týden vydrží bez problémů.
Všechny SEKVENACE jsou zpracovávány v Biocevu. Vzorky dávejte do označené krabice v lednici a pro jistotu označte sáček SQ.
Fragmentační analýza zůstává na zpracování ve Viničné 7, stále na stejném přístroji. Vzorky dávejte do mrazáčkové poličky a pro jistotu označte sáček FR.
Pokud reakce neproběhla, něco je špatně. Neposílejte tytéž vzorky připravené stejným způsobem, nebude to lepší! Zkontrolujte na novém nanodropu čistotu (hl. u PCR fragmentů). Zkontrolujte, zda máme správné primery (hl. u plasmidů). Konzultujte nastalou situaci s námi a zašlete zvlášť DNA a primery. Koncentraci a čistotu DNA ještě přeměříme a případně DNA přečistíme a sami sekvenační reakci namícháme.
Prosíme dodržujte:
1 sample = 1 tube (0,2ul) = 1 row in sample sheet
DOPORUČENÍ PRO PŘÍPRAVU VZORKŮ NA SEKVENAČNÍ REAKCI.
KONCENTRACE: 5ng/100pb u PCR produktů a 3ng/100pb plasmidové DNA (započítává se celá délka plasmidu), odpovídá 100-200ng do reakce (max. 300ng u velkých plasmidů). Pokud vám sekvenace chodí dobře, koncentraci samozřejmě neměňte!
V sekci užitečné informace je nově část NEJČASTĚJŠÍ PROBLÉMY.
Stahujte si, prosím, aktuální průvodky.
Doručovací adresa:
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
Příjem vzorků na sekvenaci v laboratoři OMICS - Genomika probíhá standardně v pondělí, ve středu a v pátek v 8 hodin.
The sequencing laboratory works in the usual way, the transfers take place again on Monday, Wednesday and Friday at 8:00.
Sběrná lednička ve Viničné
POZOR, od 11. 5. 2020 změna času převozu v pondělí !
Převoz vzorků z Viničné do Biocevu:
po - ráno = vzorky do 8.00
st - ráno = vzorky do 8.00
pá - ráno = vzorky do 8.00
ostatní dny - příležitostně
Vzorky můžete do lednice ukládat průběžně, buďte bez obav, i týden vydrží bez problémů.
Všechny SEKVENACE jsou zpracovávány v Biocevu. Vzorky dávejte do označené krabice v lednici a pro jistotu označte sáček SQ.
Fragmentační analýza zůstává na zpracování ve Viničné 7, stále na stejném přístroji. Vzorky dávejte do mrazáčkové poličky a pro jistotu označte sáček FR.
Pokud reakce neproběhla, něco je špatně. Neposílejte tytéž vzorky připravené stejným způsobem, nebude to lepší! Zkontrolujte na novém nanodropu čistotu (hl. u PCR fragmentů). Zkontrolujte, zda máme správné primery (hl. u plasmidů). Konzultujte nastalou situaci s námi a zašlete zvlášť DNA a primery. Koncentraci a čistotu DNA ještě přeměříme a případně DNA přečistíme a sami sekvenační reakci namícháme.
Prosíme dodržujte:
1 sample = 1 tube (0,2ul) = 1 row in sample sheet
DOPORUČENÍ PRO PŘÍPRAVU VZORKŮ NA SEKVENAČNÍ REAKCI.
KONCENTRACE: 5ng/100pb u PCR produktů a 3ng/100pb plasmidové DNA (započítává se celá délka plasmidu), odpovídá 100-200ng do reakce (max. 300ng u velkých plasmidů). Pokud vám sekvenace chodí dobře, koncentraci samozřejmě neměňte!
V sekci užitečné informace je nově část NEJČASTĚJŠÍ PROBLÉMY.
Stahujte si, prosím, aktuální průvodky.
Doručovací adresa:
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
Fragmentační analýza zůstává na zpracování ve Viničné 7, stále na stejném přístroji. Vzorky dávejte do mrazáčkové poličky a pro jistotu označte sáček FR.
Pokud reakce neproběhla, něco je špatně. Neposílejte tytéž vzorky připravené stejným způsobem, nebude to lepší! Zkontrolujte na novém nanodropu čistotu (hl. u PCR fragmentů). Zkontrolujte, zda máme správné primery (hl. u plasmidů). Konzultujte nastalou situaci s námi a zašlete zvlášť DNA a primery. Koncentraci a čistotu DNA ještě přeměříme a případně DNA přečistíme a sami sekvenační reakci namícháme.
Prosíme dodržujte:
1 sample = 1 tube (0,2ul) = 1 row in sample sheet
DOPORUČENÍ PRO PŘÍPRAVU VZORKŮ NA SEKVENAČNÍ REAKCI.
KONCENTRACE: 5ng/100pb u PCR produktů a 3ng/100pb plasmidové DNA (započítává se celá délka plasmidu), odpovídá 100-200ng do reakce (max. 300ng u velkých plasmidů). Pokud vám sekvenace chodí dobře, koncentraci samozřejmě neměňte!
V sekci užitečné informace je nově část NEJČASTĚJŠÍ PROBLÉMY.
Stahujte si, prosím, aktuální průvodky.
Doručovací adresa:
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
1 sample = 1 tube (0,2ul) = 1 row in sample sheet
DOPORUČENÍ PRO PŘÍPRAVU VZORKŮ NA SEKVENAČNÍ REAKCI.
KONCENTRACE: 5ng/100pb u PCR produktů a 3ng/100pb plasmidové DNA (započítává se celá délka plasmidu), odpovídá 100-200ng do reakce (max. 300ng u velkých plasmidů). Pokud vám sekvenace chodí dobře, koncentraci samozřejmě neměňte!
V sekci užitečné informace je nově část NEJČASTĚJŠÍ PROBLÉMY.
Stahujte si, prosím, aktuální průvodky.
Doručovací adresa:
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
Štěpánka Hrdá, Core facility - Genomika, PřF UK, Biocev, Průmyslová 595, Vestec, 252 50.
Konzultace na fakultě po domluvě.
Box na vzorky v Biocevu najdete vedle recepce - schránka je označena fialově (pozor - pod ní je zelená schránka soukromé firmy).
Vzorky pro Macrogen nadále nebudeme odesílat. Odeslání si zajišťuje každý sám uložením své objednávky do sběrného boxu Macrogenu, který je umístěn v budově Benátská 4, na sekretariátu katedry botaniky, naproti vstupním dveřím. Je k dispozici všem zaměstnancům a studentům PřF UK. Vzorky s vytištěnou objednávkou se vloží do jakéhokoli uzavíratelného sáčku a ten se umístí do sběrného boxu (není žádný požadavek na minimální počet vzorků). Každé úterý a čtvrtek večer bude sběrný box zkontrolován kurýrem UPS a všechny vzorky budou zaslány do Macrogenu.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
V laboratoři v Biocevu ve Vestci máme přístroj MiSeq Illumina, na kterém můžeme analyzovat Vámi připravené knihovny. Vybrané knihovny jsme schopni pro Vás také připravit.
Laboratoř dále nabízí
- sonikaci na ultrasonikátoru Covaris M220, včetně sonikačních minizkumavek - objem 50 nebo 130 ul.
- přesné měření kvantity DNA/RNA na fluorimetru Quantus.
- analýzu na přístroji Agilent 2100 Analyzer - cena dle typu čipu na doptání. Čipy jsou na 11-12 vzorků. Při menším počtu vzorky uskladníme do doby, než se čip zaplní.
Laboratoř poskytuje servisní služby v oblasti sekvenační a fragmentační analýzy DNA jak pro vědecké pracovníky a studenty biologické sekce PřF UK, tak i pro všechny ostatní zájemce z univerzitních a akademických pracovišť.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
Samostatná laboratoř sekvenace DNA vznikla v roce 2003. V současnosti jsou v laboratoří tři analyzátory: čtyřkapilární 3130 Genetic Analyzer (2007), šestnáctikapilární 3130xl Genetic Analyzer (2010) a dvacetičtyřkapilární 3500 Genetic Analyzer (2015) od firmy Applied Biosystems.
Nabízíme:
1. Sekvenaci plasmidů a PCR produktů zahrnující sekvenační reakci a analýzu na genetickém analyzátoru
(Nesekvenujeme PCR produkty kratší než 100pb a genomovou DNA, fosmidy a kosmidy, neboť na ně nemáme vypracovanou spolehlivou metodiku. Pokud však budete mít zájem, můžeme to zkusit.)
2. Analýzu již hotových přečištěných sekvenačních produktů
3. Fragmentační analýzu
4. Možnost využívání přístroje Nanodrop® v laboratoři S003 ve II. suterénu ve Viničná 7 nebo v místnosti M1.024 v BIOCEVU ve Vestci
5. Možnost využívání přístrojů sekvenátoru Miseq, sonikátoru Covaris, bioanalyzátoru Agilent a fluorometru Qvantus, stejně jako vybavení laboratoře pro přípravu knihoven v BIOCEVU.
6. Možnost vyhodnotit své výsledky u nás v laboratoři programy firmy Applied Biosystems SeqScape® Software a GeneMapper® Software.
7. Laboratoř má zakoupeno 30 síťových licencí programového balíku Geneious .Přístup k programu je možný z počítačů připojených na intranet, přístupové heslo interním uživatelům na vyžádání pošleme.
Akce dokumentů