Josef Brůna

• Email: bruna1(at)natur.cuni.cz 
• Workplace: Institute of Botany of the CAS, Průhonice, Department of GIS and RS
• PhD thesis: Use of remote sensing for monitoring long term dynamics of vegetation on a landscape scale
• PhD 2009-2018
• Superivisor: doc. Ing. Jan Wild PhD.
• 
  ResearcherID: A-6601-2010  ORCID ID 0000-0002-4839-4593

Projects

2019-2023 Macroecology of Plant Invasions: Global Synthesis across Habitats (SynHab). Principal investigator Petr Pyšek. GAČREXPRO 19-28807X.

2018-2021 UAS approach for monitoring of plant invasions over different spatial and temporal scales. Principal investigator Jana Müllerová MŠMT LTC18007.

2018-2020 EFI Network FORest MAnagement Scenarios for Adaptation and Mitigation (FORMOSAM) principal investigator Christopher Reyer.

2018-2022 Microclimate characteristics of natural forest stages influenced by disturbances and management (contractual research for NP Šumava).

2017 – 2019 Trans-boundary mapping of forest ecosystems – Interreg Trans-boundary cooperation – Czech Republic – Free State of Bavaria, Germany, Interreg project no 99. Principal investigator since 2018.

2017 - 2021 MC Substitute of COST: CA16219 Harmonization of UAS techniques for agricultural and natural ecosystems monitoring (HARMONIOUS)

2017 - 2019 coinvestigator Forest microclimate – neglected link between plant diversity and climate change. Principal investigator: Jan Wild. GAČR GA17-13998S.

2015 - 2017 coinvestigator Modelling of large scale multi-agents disturbances in mountain spruce forests. principal investigator: Jan Wild, LD15158 - COST CZ.

2014 - 2017 Detection and monitoring of invasive species using unmanned aircraft, principal investigator Jana Müllerová, TAČR TA04020455.

2014 - 2018 Excelence project: Plant diversity analysis and synthesis centre (PLADIAS), principal investigator Milan Chytrý. GAČR GB14-36079G.

2014- 2018 MC Substitute of COST: FP 1304 Towards robust projections of European forests under climate change (PROFOUND)

2012 - 2014 coinvestigator Wild ungulates and their influence on vegetation in abandoned landscape, principal investigator Eva Horčičková,  GAUK (Projekt 630112)

2010 – 2012  Use of high resolution remote sensing data for modeling of tree dispersal, principal investigator Josef Brůna, GAUK (Project 20310).

2010 – 2014  The role of disturbances in dynamics of temperate mountain spruce-dominated forests – a landscape simulation model of the Šumava Mts., principal investigator T. Herben, GAČR (Project 504/10/0843).

2009 - 2010  participation on project Natural dynamics of the mountain spruce forest after large disturbance: spatial explicit individual-based model, principal investigator  J. Wild. MŽP (Project SP/2D2/111/08).

2006 - 2008  participation on project  Dynamics of spreading of woody species in central European landscape, principal investigator T. Herben. GAČR (Project 526/06/0818).

Publications

Lembrechts J.J., Aalto J., Ashcroft M.B., De Frenne P., Kopecký M., Lenoir J., Luoto M., Maclean I.M.D., Roupsard O., Fuentes‐Lillo E., García R.A., Pellissier L., Pitteloud C., Alatalo J.M., Smith S.W., Björk R.G., Muffler L., Cesarz S., Gottschall F., Backes A.R., Okello J., Urban J., Plichta R., Svátek M., Phartyal S.S., Wipf S., Eisenhauer N., Pușcaș M., Dan Turtureanu P., Varlagin A., Dimarco R.D., Jump A.S., Randall K., Dorrepaal E., Larson K., Walz J., Vitale L., Svoboda M., Finger Higgens R., Halbritter A.H., Curasi S.R., Klupar I., Koontz A., Pearse W.D., Simpson E., Stemkovski M., Graae B.J., Vedel Sørensen M., Høye T.T., Fernández Calzado M.R., Lorite J., Carbognani M., Tomaselli M., Forte T.G.W., Petraglia A., Haesen S., Somers B., Van Meerbeek K., Björkman M.P., Hylander K., Merinero S., Gharun M., Buchmann N., Dolezal J., Matula R., Thomas A.D., Bailey J.J., Ghosn D., Kazakis G., de Pablo M.A., Kemppinen J., Niittynen P., Rew L., Seipel T., Larson C., Speed J.D.M., Ardö J., Cannone N., Guglielmin M., Malfasi F., Bader M.Y., Canessa R., Stanisci A., Kreyling J., Schmeddes J., Teuber L., Aschero V., Čiliak M., Máliš F., De Smedt P., Govaert S., Meeussen C., Vangansbeke P., Gigauri K., Lamprecht A., Pauli H., Steinbauer K., Winkler M., Ueyama M., Nuñez M.A., Ursu T., Haider S., Wedegärtner R.E.M., Smiljanic M., Trouillier M., Wilmking M., Altman J., Brůna J., Hederová L., Macek M., Man M., Wild J., Vittoz P., Pärtel M., Barančok P., Kanka R., Kollár J., Palaj A., Barros A., Mazzolari A.C., Bauters M., Boeckx P., Benito Alonso J.L., Zong S., Di Cecco V., Sitková Z., Tielbörger K., van den Brink L., Weigel R., Homeier J., Dahlberg C.J., Medinets S., Medinets V., De Boeck H.J., Portillo‐Estrada M., Verryckt L.T., Milbau A., Daskalova G.N., Thomas H.J.D., Myers‐Smith I.H., Blonder B., Stephan J.G., Descombes P., Zellweger F., Frei E.R., Heinesch B., Andrews C., Dick J., Siebicke L., Rocha A., Senior R.A., Rixen C., Jimenez J.J., Boike J., Pauchard A., Scholten T., Scheffers B., Klinges D., Basham E.W., Zhang J., Zhang Z., Géron C., Fazlioglu F., Candan O., Sallo Bravo J., Hrbacek F., Laska K., Cremonese E., Haase P., Moyano F.E., Rossi C. & Nijs I. (2020) SoilTemp: a global database of near‐surface temperature. Global Change Biology 131: gcb.15123. https://doi.org/10.1111/gcb.15123

Pergl J., Petřík P., Fleischhans R., Adámek M. & Brůna J. (2020) Telekia speciosa (Schreb.) Baumg. in human made environment: spread and persistence, two sides of the same coin. BioInvasions Records 9: 17–28. https://doi.org/10.3391/bir.2020.9.1.03

Červenka, J., Bače, R., Brůna, J., Wild, J., Svoboda, M., & Heurich, M. (2019). Mapping of mountain temperate forest recovery after natural disturbance : a large permanent plot established on Czech-German border. Silva Gabreta, 25, 31–41. online

Bugmann, H., Seidl, R., Hartig, F., Bohn, F., Brůna, J., Cailleret, M., François, L., Heinke, J., Henrot, A.-J., Hickler, T., Hülsmann, L., Huth, A., Jacquemin, I., Kollas, C., Lasch-Born, P., Lexer, M.J., Merganič, J., Merganičová, K., Mette, T., Miranda, B.R., Nadal-Sala, D., Rammer, W., Rammig, A., Reineking, B., Roedig, E., Sabaté, S., Steinkamp, J., Suckow, F., Vacchiano, G., Wild, J., Xu, C., Reyer, C.P.O. (2019) Tree mortality submodels drive simulated long-term forest dynamics: assessing 15 models from the stand to global scale. Ecosphere 10, 1–22. doi: 10.1002/ecs2.2616

Wild, J., Kaplan, Z., Danihelka, J., Petřík, P., Chytrý, M., Novotný, P., Rohn M., Šulc V., Brůna J., Chobot K., Ekrt L., Holubová D., Knollová I., Kocián P., Štech M., Štěpánek J. & Zouhar V. (2019). Plant distribution data for the Czech Republic integrated in the Pladias database. Preslia, 91(1), 1–24. http://doi.org/10.23855/preslia.2019.001

Horčičková E., Brůna J., Vojta J.(2019)  Wild boar (Sus scrofa) increases species diversity of semidry grassland: Field experiment with simulated soil disturbances. Ecology and  Evolution 9(5): 2765-2774. https://doi.org/10.1002/ece3.4950

Vojta J., Brůna J., Horčičková E., Kačmarová L. (2018) Sukcese bezzásahových křovin a lesů ve vojenském újezdu Hradiště. S. 189-192 in Jongepierová I., Pešout P., Prach K. (ed.) Ekologická obnova v České republice II, AOPK ČR, Praha,  ISBN 978-80-88076-83-4.

Kaplan Z., Koutecký P., Danihelka J., Šumberová K., Ducháček M., Štěpánková J., Ekrt L., Grulich V., Řepka R., Kubát K., Mráz P., Wild J. & Brůna J. (2018): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 6. – Preslia 90: 235–346. doi: 10.23855/preslia.2018.235.

Röder, M., Latifi, H., Hill, S., Wild, J., Svoboda, M., Brůna, J., Macek, M., Nováková, M. H., Gülch, E., Heurich, M. (2018). Application of optical unmanned aerial vehicle-based imagery for the inventory of natural regeneration and standing deadwood in post-disturbed spruce forests. International Journal of Remote Sensing, 39(15-16), 5288-5309 . doi: 10.1080/01431161.2018.1441568

Müllerová, J., Bartaloš, T., Brůna, J., Dvořák, P., & Vítková, M. (2017). Metodika mapování invazních druhů pomocí dálkového průzkumu. Botanický ústav AV ČR, Průhonice. Certified by Ministry of the Environment of the Czech Republic.

Müllerová, J., Brůna, J., Bartaloš, T., Dvořák, P., Vítková, M., & Pyšek, P. (2017). Timing Is Important: Unmanned Aircraft vs. Satellite Imagery in Plant Invasion Monitoring. Frontiers in Plant Science, 8(May), 1–13. 10.3389/fpls.2017.00887

Čuda, J., Rumlerová, Z., Brůna, J., Skálová, H., Pyšek, P. (2017) Floods affect the abundance of invasive Impatiens glandulifera and its spread from river corridors. Diversity and Distributions 23(4). 342-354. doi:10.1111/ddi.12524

Müllerová, J., Bartaloš, T., Brůna, J., Dvořák, P., Vítková, M. (2017) Unmanned aircraft in nature conservation: an example from plant invasions. International Journal of Remote Sensing 38(8-10):2177-2198. doi: 10.1080/01431161.2016.1275059

Štajerová, K., Šmilauer, P., Brůna, J., Pyšek, P. (2017). Distribution of Invasive Plants in Urban Environment Is Strongly Spatially Structured. Landscape Ecology 32(3): 681-692. doi:10.1007/s10980-016-0480-9.

Macek, M.; Wild, J.; Kopecký, M.; Červenka, J.; Svoboda, M.; Zenáhlíková, J.; Brůna, J.; Mosandl, R.; Fischer, A. (2017) Life and death of Picea abies after bark-beetle outbreak: ecological processes driving seedling recruitment. Ecological Applications 27: 156–167. doi: 2016. 10.1002/eap.1429.

Hais, M.; Wild, J.; Berec, L.; Brůna, J.; Kennedy, R.; Braaten, J.; Brož, Z. Landsat Imagery Spectral Trajectories — Important Variables for Spatially Predicting the Risks of Bark Beetle Disturbance. Remote Sens. 2016, 8, 1–22.

Zdeněk Kaplan; Danihelka, J.; Štěpánková, J.; Ekrt, L.; Chrtek, J.; Zázvorka, J.; Grulich, V.; Řepka, R.; Prančl, J.; Ducháček, M.; Kůr, P.; Šumberová, K.;Brůna, J. Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 2. Preslia 2016, 88, 229–322.

Müllerová, J.; Brůna, J.; Dvořák, P.; Bartaloš, T.; Vítková, M. DOES THE DATA RESOLUTION/ORIGIN MATTER? SATELLITE, AIRBORNE AND UAV IMAGERY TO TACKLE PLANT INVASIONS. In The International Archives of the Photogrammetry, Remote Sensing and Spatial Information Sciences; Prague, 2016; Vol. XLI, pp. 903–908.

Dvořák, P., Müllerová, J., Bartaloš, T., and Brůna, J.:UNMANNED AERIAL VEHICLES FOR ALIEN PLANT SPECIES DETECTION AND MONITORING, Int. Arch. Photogramm. Remote Sens. Spatial Inf. Sci., XL-1/W4, 83-90, doi:10.5194/isprsarchives-XL-1-W4-83-2015, 2015.

J. Brůna, J. Wild, M. Svoboda, M. Heurich, J. Müllerová (2013) Impacts and underlying factors of landscape-scale, historical disturbance of mountain forest identified using archival documents, 294-306. In Forest Ecology and Management305. http://dx.doi.org/10.1016/j.foreco.2013.06.017

Čada, Svoboda, Janda, Rejzek, Bače, Wild, Brůna(2013) Původ a historie narušení horských smrčin Šumavy – předběžné výsledky. Sborník z konference Lesník 21. století. 9 stran.

Vojta J.,Brůna J., Kubát M., Drhovská L.(2012) Případová studie: Doupovské hory – biodiverzita vs. velkoplošná sukcese. In: Machar I., Drobilová L. a kolektiv Ochrana přírody a krajiny v České republice Vybrané aktuální problémy a možnosti jejich řešení, část Případové studie. Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc.

Brůna, J. (2012) Use of high resolution remote sensing data for modelling of tree dispersal. in Modelling Forest Ecosystems - Concepts, Data and Application Proceedings of the COST FP0603 Spring School, May 9th - 13th, 2011, Kaprun, Austria. Eds: Pötzelsberger, Mäkelä, Hasenauer, Mohren, Palahí, Tomé. Universität f. Bodenkultur, Wien. ISBN 978-3-900962-98-2.

Červenka, J., Wild, J., Svoboda, M., Kopecký, M., Macek, M., Brůna, J., Zenáhlíková, J. The state of the natural regeneration in Bavarian Forest National Park, 10 years after the total death parent stands. 2011. ISBN: 978-80-213-2086-1; Počet stran: 279 str. ; Vydavatel: ČZU v Praze; COYOUS 2011.

Brůna, J. (2010) Modelování změn krajinného pokryvu v opuštěné krajině s využitím série leteckých snímků. Sborník z konference SGP 2010. Arcadata, Praha ISBN 978–80–904450–3–1, 80-87.

Brůna (2009) PEMZOK - Prostorově explicitní model zarůstání opuštěné krajiny (software) 1.0.1.5 http://sites.google.com/site/pemzok/home

Other results

Software PEMZOK - Spatially explicit model of abandoned landscape change

Conferences

Attended

Výroční konference CZ-IALE 2009 "GEO BIO DIVERZITA: integrující perspektivy" (2009) Praha
17th GIS ESRI in Ctźech republic conference (2008) Praha
Geomatika v Projektech (2010), Kozel
Trimble GIS Express (2010), Praha
Nová podrobná data z optických i radarových družic (2010), Praha
Praktické využití GIS v lesnictví a zemědělství (2010), Křtiny
WSES - World student environmental summit (2011) Karlskrona, Sweden
Trimble GIS Express (2011), Praha
20th konference GIS ESRI v ČR (2011) Praha
WSES - World Student Environmental Summit (2012) Lausanne, Switzerland
Trimble GIS Express (2012) Praha
Historická geografie v digitálním světě (2013) Praha
Probing Vegetation Conference (2013) Antwerpen, Belgium
22nd konference GIS ESRI v ČR (2013) Praha
WSES - World Student Environmental Summit (2013) Lüneburg, Germany
European Space Solutions (2014) Praha
Trimble GIS Express (2015) Praha
Advancing horizons for land cover services entering the big data era (2016) Praha
Trimble GIS Express (2016) Praha
RPAS (Remotely Piloted Aircraft Systems) (2016) Telč

Presented

Geologisk symposium (2008) Aarhus, Dánsko
IGU-LUCC Conference (2010) „Land use and land cover changes in a globalised world“, Praha
Student GIS Project (2010), Kozel
New approaches in land cover/use change research (2010), Praha
Frontiers in Hitorical Ecology (2011) Zürich, Switzerland
Spatial Ecology & Conservation (2011) Birmingham, Great Britain
EARSeL-Temporal Analysis of Satellite Images (2012) Mykonos, Greece
ECCB - European Congress of Conservation biology (2012) Glasgow, Scotland, UK
21st GIS ESRI in Czech republic conference (2012) Praha
Natural Disturbance Conference (2013) Neuschönau, Germany
56 th IAVS conference (2013) Tartu, Estonia
GEOBIA (2014) Thessaloniki, Greece
FORDISMAN(2014) Tartu, Estonia
23rd konference GIS ESRI v ČR (2014) Praha
Praktické využití GIS v lesnictví a zemědělství (2015), Brno
24th Conference GIS ESRI in CR (2015) Praha 
Living Planet Symposium (2016) Praha
GEOBIA (2016) Enschede, Netherlands
25th GIS ESRI in CR conference (2016) Praha
EMAPI 14 (2017) Lisbon, Portugal
26. konference GIS ESRI v ČR (2017) Praha

Oponentures of thesis

BP - Jiří Tichý (2010) Vyhodnocení přirozeného zmlazení smrku ztepilého (Picea abies L.) na gradientu prostředí pískovcového skalního města (NP České Švýcarsko). Česká zemědělská univerzita v Praze, Fakulta lesnická a dřevařská, Katedra pěstování lesů.
BP - Daniela Hojcsková (2010) Mapování povodí Litavky s využitím GIS. ÚŽP
BP - Alena Vávrová (2010) Historický rozvoj spontánní vegetace na výsypkách v okolí Sokolova. ÚŽP
BP - Zuzana Klagová (2010) Princípy výmeny dominánt v pionýrských lesoch. Botanika PřF
BP - Vojtěch Stráník (2011) Mapování toků biomasy ve vybraném regionu s využitím GIS. ÚŽP
DP - Jan Purkyt (2012) Analýza a hodnocení dynamiky vývoje lesa na Mostecku. FŽP ČZU
BP - Pavel Wiesner (2012) Vliv křovin na uchycování dřevin v pastevní krajině. Katedra botaniky PřF UK
DP - Václava Maťašovská (2013) Prediktivní modelování výskytu rostlinných druhů rodu křídlatka (Reynoutria) na Šluknovsku na základě stanovištních nároků FŽP ČZU
DP - Jan Vodička (2015) Model šíření spontánní vegetace na nerekultivovaných částech velké podkrušnohorské výsypky. ÚŽP, PřF UK.
BP Ondřej Mevald (2016) Dynamika produktivity bylinného patra v teplomilné doubravě v přírodní rezervaci Na Voskopě (Český kras) v závislosti na intenzitě slunečního záření. FLD ČZU.
BP Jana Hernová (2017) Využití družicových dat programu Copernicus pro environmentální výzkum s případovou studií zaměřenou na vyhodnocení REP rekultivovaných ploch v okolí jezera Medard. ÚŽP, PřF UK.
BP Kateřina Fialová (2017) Využití bezpilotních prostředků v získávání dat o životním prostředí ÚŽP, PřF UK.
BP Dominika Houdová (2018) Využití satelitních snímků v environmentálním výzkumu pro indentifikaci městkých tepelných ostrovů a jejich souvislosti s okolním prostředím s případnou studií na územní Prahy, ÚŽP, PřF UK.

Publication unrelated to the thesis

Brůna, Josef.  Metodický portál, Články: „Navrhni svůj ekodům“ [online]. 11. 03. 2010.[cit.27. 03. 2010.]. ISSN 1802-4785. Dostupný z WWW: <http://clanky.rvp.cz/clanek/c/G/7355/NAVRHNI-SVUJ-EKODUM.html>

Brůna, Josef. Metodický portál, Články: „Bydlíme s přírodou – veřejná zeleň“ [online]. 06. 04. 2010.[cit.07. 04. 2010.]. ISSN 1802-4785. Dostupný z WWW: <http://clanky.rvp.cz/clanek/c/Z/8453/BYDLIME-S-PRIRODOU-–-VEREJNA-ZELEN.html>.

Brůna, Josef (2010) E-learningový kurz Projektu 3V. In Alternativní metody výuky 2010, sborník příspěvků, GAUDEAMUS Hradec Králové, ISBN 978-80-7435-043-6.

Brůna, Josef; Semeráková, Bára (2011) Towards Science and Research. In Multi-Actor Learning for Sustainable Regional Development in Europe: A Handbook of Best Practice, editors Andrew Barton & Jana Dlouhá. p 247 - 264. Grosvenor House Publishing Ltd. ISBN 978-1-908105-33-2

Brůna, Josef (2010) E-learningový kurz Projektu 3V - Vědě a výzkumu vstříc. In Alternativní metody výuky 2011, sborník příspěvků, editors Miroslav Ulrich & Karel Zatloukal GAUDEAMUS Hradec Králové, ISBN 978-80-7435-104-4.

Kolektiv autorů (2010) Metodické materiály Projekt3V - Vědě a výzkumu vstříc. Praha.http://www.projekt3v.cz/

Kolektiv autorů (2014) Metodické materiály Badatelé.cz. Prahahttp://www.badatele.cz/metodicke-materialy.html