E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



Modelování chemických vlastností nano- a biostruktur

Charakteristika oboru

Postgraduální studium je organizováno katedrou fyzikální a makromolekulární chemie ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR a pokrývá oblast výpočetní chemie, kvantové chemie a molekulárního modelování. Studium je zaměřeno jak na studium biomakromolekul (DNA a proteiny) tak i komplexních molekulárních systémů a v rámci PGS lze řešit následující projekty:

  1. struktura a dynamika párů a oligomerů DNA v základním a elektronově excitovaném stavu
  2. interakce DNA s proteiny a ligandy
  3. studium nekovalentních interakcí a zejména standardní a nepravé vodíkové vazby
  4. Stabilizující interakce v biomolekulách - peptidy a proteiny a teoretický model sbalování proteinů
  5. strukturální bioinformatika
  6. teoretické studium chemické reaktivity a katalýzy
  7. fyzikální a chemické vlastnosti molekulových sít
  8. vývoj metod k popisu statických a dynamických vlastností slabě výzaných systémů
  9. studium uhlíkových nanostruktur
  10. interakce biologicky relevantních iontů s hydratovanými proteiny
  11. struktura a dynamika iontů v roztocích a na rozhraních
  12. fyzikální a chemické procesy na atmosférických aerosolech
  13. struktura, dynamika a funkce RNA a DNA

Koncepce postgraduálního studia vychází jak ze zkušeností garantů PGS, tak také odráží moderní trendy ve výpočetní chemii a molekulovém modelování.

Nabídka specializovaných přednášek a seminářů

Kvantová chemie
Počítačová chemie
Molekulární struktura a spektroskopie
Vibrační spektroskopie
Chemická termodynamika
Statistická termodynamika
Počítačové simulace ve fyzice mnoha částic
Biofyzikální chemie
Klasická a kvantová molekulová dynamika
Fyzika Proteinů
Bioinformatika
Strukturní biofyzika nukleových kyselin

Další přednášky si lze vybrat se svolením školitele a oborové rady z PGS a magisterského programu Přírodovědecké fakulty UK, jiných fakult UK (např. Matematicko-fyzikální fakulty UK, lékařských fakult UK, ap.) i jiných pražských vysokých škol (VŠCHT, FJFI ČVUT, ap.).

Výzkumné tématiky rozvíjené na ÚOCHB AV ČR

  • Kvantově chemické ab initio výpočty
  • Nekovaletní interakce
  • Struktura a dynamika biomakromolekul
  • Elektronově excitované stavy isolovaných molekul a jejich komplexů
  • Stabilizující interakce v biomolekulách
  • Termodynamický popis biochemických procesů
  • Hydrofobní interakce a jejich úloha ve strukturální biologii
  • Chemická reaktivity a katalýza
  • Fyzikální a chemické vlastnosti molekulových sít
  • DFT přístupy k popisu slabě vázaných systémů
  • Uhlíkové nanostruktury
  • Interakce iontů s proteiny
  • Struktura a dynamika povrchů elektrolytů

Obhájené disertační práce

Požadavky oborové rady

Oborová rada

Akce dokumentů