Zpracování a analýza mikroskopických obrazů v biomedicíně
Náplní kurzu budou základy práce s obrazem, tj. sběr dat, zpracování a analýza obrazů včetně moderních stereologických metod. Kromě teorie bude velký důraz kladen na praktická cvičení s využitím volně dostupného programu Fiji (fiji.sc). Účastníci jej budou využívat pro zlepšení obrazu, budou řešit biologické úlohy, jako jsou analýza kolokalizace obrazů, analýza dat z metody FRAP nebo z elektronové mikroskopie, sledování pohybu buněk a segmentace objektů. Obtížnější segmentaci budou řešit trénovatelným algoritmem v programu ilastik (ilastik.org), budou restaurovat obrazová data pomocí dekonvoluce v programu Huygens (svi.nl). Součástí budou dále lekce s programem Imaris (http://www.bitplane.com/imaris/imaris), včetně praktických cvičení na firemních počítačích, které povede odborný specialista z firmy.
Podrobné informace o kurzu a odkaz na on-line registrační formulář naleznete na stránkách kurzu (http://microscopytraining.eu/imageprocess/). Kurz volně navazuje na Mikroskopické metody v biomedicíně, který je vhodným úvodem, nicméně účast na tomto kurzu není nutná.
Kurz bude vyučován v anglickém jazyce.
S pozdravem a jménem organizátorů,
Michaela Efenberková a Martin Čapek
Akce dokumentů