Schválená témata bakalářských a diplomových prací

Nabídka části témat bakalářských a diplomových pro akademický rok 2023-24

Katedra biochemie nabízí studentům níže uvedená témata bakalářských (pdf ke stažení) a diplomových (pdf ke stažení) projektů. Je zvykem, že studenti nejprve kontaktují školitele tématu, které je nejvíce oslovuje, a domluví se s ním na spolupráci (e-mailový kontakt je uveden v SIS). Je potřeba počítat s tím, že školitelé se již mohli domluvit s jinými studenty, kteří byli v jednání rychlejší nebo pokračují ve své práci z bakalářského studia. Nabízených témat je nicméně výrazně více, než studentů zapsaných v prvním ročníku navazujícího magisterského studia (v případě diplomové práce) nebo ve třetím ročníku bakalářského studia (v případě bakalářské práce), není proto třeba se obávat, že na někoho žádné téma nezůstane. Nenechejte však výběr Vaší práce na poslední chvíli!

Dle harmonogramu budou do 1. 11. 2023 všechna témata vypsána do SISu a studenti se na ně po dohodě se školitelem dané práce nejpozději do 12. 1. 2024 přihlásí. Poté školitelé potvrdí, že budou přihlášené studenty školit, a pak již nic nebrání tomu, aby studenti na daném projektu začali pracovat.

Seznam bakalářských prací

Bělonožníková Kateřina (PřF UK; katerina.belonoznikova@natur.cuni.cz)

BP1: Charakterizace přírodních biostimulantů a jejich vliv na kvalitu půdy (konzultant: prof. H. Ryšlavá)

Bojarová Pavla (MBÚ AV ČR, v.v.i.; bojarova@biomed.cas.cz)

BP1: Exprese a vazebné vlastnosti lidského galektinu-7 (konzultant: Mgr. M. Hovorková)

Etrych Tomáš (AV ČR, v.v.i.; etrych@imc.cas.cz)

BP1: Cílená léčiva na bázi hybridních systémů protilátka-syntetický polymer (konzultant: Dr. P. Chytil)

BP2: Příprava polymerem modifikovaných trombolyt pro léčbu cévní mozkové příhody (konzultant: Dr. A. Libánská)

Hansíková Hana (1. LF UK, Hana.Hansikova@vfn.cz)

BP1: Studium patomechanismů deficience komplexu I a III mitochondriálního dýchacího řetězce

BP2:  Mitochondriální biomarkery u Friedreichovy ataxie (konzultant: Mgr. M. Vanišová)

BP3:  Dopad mírné a těžké hypoxie na mitochondriální metabolismus (konzultant: Mgr. J. Křížová)

BP4:  Studium dědičných poruch glykosylace pomocí průtokové cytometrie (konzultant: Dr. N. Ondrušková) z minulého roku

Heidingsfeld Olga (PřF UK/ÚOCHB AV ČR v.v.i., olga.heidingsfeld@natur.cuni.cz)

BP1: Interakce patogenních kvasinek s bakteriemi

Hodek Petr (PřF UK; petr.hodek@natur.cuni.cz)

BP1: Studium profylaktického účinku slepičích protilátek na kvasinková onemocnění

BP2: Výzkum formulace slepičích protilátek pro terapeutické aplikace

Hýsková Veronika (PřF UK, veronika.hyskova@natur.cuni.cz)

BP1: Okamžitá odezva antioxidačního systému rostlin kukuřice (Zea mays L.) na působení léčiva

Chmelík Josef (PřF UK, chmelik@biomed.cas.cz)

BP1: Studium konformačního chování cyklosporinu A pomocí NMR spektroskopie

Indra Radek (PřF UK, radek.indra@natur.cuni.cz)

BP1: Predispozice k rakovině u cystické fibrózy – vliv benzo[a]pyrenu

Ječmen Tomáš (PřF UK, tomas.jecmen@natur.cuni.cz)

BP1: Vliv složení detritu na růst a vývoj kriticky ohrožené perlorodky říční (konzultant: Dr. K. Bělonožníková)

BP2: Exprese a purifikace mutantů cytochromu b₅ s nepřirozenými aminokyselinami (konzultant: Dr. V. Černá)

Jeřábek Petr (PřF UK, petr.jerabek@natur.cuni.cz)

BP1: Studium dynamiky přístupových tunelů k aktivnímu centru cytochromů P450 metodami molekulového modelování

Koblas Tomáš (IKEM; tokb@medicon.cz)

BP1: In vitro příprava a charakterizace modifikovaných mediátorových RNA pro účely buněčné terapie

Konvalinka Jan (ÚOCHB AV ČR v.v.i.; jan.konvalinka@uochb.cas.cz)

BP1: Rekombinantní exprese, purifikace a charakterizace povrchového imunoreceptoru CD47 (integrin associated protein).

Kukačka Zdeněk (Biocev AV ČR v.v.i., zdenek.kukacka@biomed.cas.cz)

BP1: Studium struktury desminu pomocí chemického zesítění

Man Petr (AV ČR, v.v.i.; pman@biomed.cas.cz)

BP1: Strukturní proteomika lidského séra.

BP2: Vliv membránových  mimetik na strukturu chloridového antiporteru

BP3: Příprava enzymových mikroreaktorů s oryzasinem.

Mašek Jan (PřF UK – buněčná biologie, jan.masek@natur.cuni.cz)

BP1: Notch Interaction with Glycogen Synthase Kinase 3 β in Neurodegenerative Disease (konzultant: Dr. P. Novák)

Novák Petr (PřF UK, novakpe1@natur.cuni.cz)

BP1: Příprava a charakterizace průtokových reaktorů pro validaci biologických léčiv

BP2: Příprava a charakterizace průtokových reaktorů pro validaci RNA vakcín

Osičková Adriana (PřF UK/AV ČR v.v.i.; osickova@biomed.cas.cz)

BP1 Studium proteinových interakcí podílejících se na acylaci α-hemolyzinu bakterie Escherichia coli

Pompach Petr (Biocev AV ČR v.v.i.; pompach@biomed.cas.cz)

BP1: Optimalizace využití imunoafinitních čipů ve spojení s hmotnostně spektrometrickou detekcí

Roubalová Radka (AV ČR, v.v.i.; r.roubalova@biomed.cas.cz)

BP1: Vliv střevní mikrobioty a mikrobiálních metabolitů na vývoj mentální anorexie v experimentálním myším modelu

Souček Pavel (SZÚ, pavel.soucek@szu.cz)

BP1: Studium faktorů korelujících s prognózou a výsledkem léčby solidních nádorů

Spálenková Alžběta (SZÚ Praha, alzbeta.spalenkova@szu.cz)

BP1: Oxysteroly a jejich význam u gastrointestinálních tumorů (konzultant: Dr. M. Čermáková)

Šulc Miroslav (PřF UK; miroslav.sulc@natur.cuni.cz)

BP1: Využití nekanonických aminokyselin pro studium koordinace kovu/elektronového přenosu v metaloproteinech (model azurinu z organismu P. aeruginosa)

BP2: Strukturně-funkční proteomika bakteriálních virulentních faktorů v procesu pathogenese (využití chemického a světlem indukovaného zesítění a hmotnostní spektrometrie)

Štufková Hana (1. LF UK, Hana.Stufkova@vfn.cz)

BP1: Mitochondriální onemocnění s maternální dědičností: určení patogenity nových/vzácných variant mitochondriální DNA (konzultant: Dr. M. Tesařová, Dr. H. Hansíková, Dr. M. Čermáková))

Tachézy Ruth (Biocev AV ČR v.v.i.; ruth.tachezy@natur.cuni.cz)

BP1: Příprava klinických materiálů pro analýzu viromu sekvenací nové generace

Vaněk Ondřej (PřF UK, ondrej.vanek@natur.cuni.cz)

BP1: Produkce rozpustných forem NK buněčných receptorů

BP2: Příprava mutovaného proteinu CD69, receptoru lidských lymfocytů

BP3: Optimalizace rekombinantní exprese proteinů v lidské buněčné linii HEK293

Seznam diplomových prací

Bělonožníková Kateřina (PřF UK; katerina.belonoznikova@natur.cuni.cz)

DP1: Charakterizace přírodních biostimulantů a jejich vliv na kvalitu půdy (konzultant: prof. H. Ryšlavá)

Bojarová Pavla (MBÚ AV ČR, v.v.i.; bojarova@biomed.cas.cz)

DP1: Příprava oligosacharidů mateřského mléka enzymovými metodami

DP2: Exprese a charakterizace nové fungální chitindeacetylasy (konzultant: Dr. K. Slámová)

Dohnálek Jan (Biocev AV ČR v.v.i.; dohnalek@ibt.cas.cz)

DP1: Nové komplexy bakteriálního transkripčního systému

Etrych Tomáš (AV ČR, v.v.i.; etrych@imc.cas.cz)

DP1: Hybridní systémy protilátka-syntetický polymer jako cílená protinádorová léčiva (konzultant: Dr. P. Chytil)

DP2: Pokročilá trombolytika pro léčbu cévní mozkové příhody (konzultant: Dr. A. Libánská)

Hansíková Hana (1. LF UK, Hana.Hansikova@vfn.cz)

DP1: Studium patomechanismů deficience komplexu I a III mitochondriálního dýchacího řetězce

DP2:  Mitochondriální biomarkery u Friedreichovy ataxie (konzultant: Mgr. M. Vanišová)

DP3:  Dopad mírné a těžké hypoxie na mitochondriální metabolismus (konzultant: Mgr. J. Křížová)

DP4:  Studium dědičných poruch glykosylace pomocí průtokové cytometrie (konzultant: Dr. N. Ondrušková) z minulého roku

Heidingsfeld Olga (PřF UK, olga.heidingsfeld@natur.cuni.cz)

DP1: Interakce lanosterol 14-alfa-demethylasy z pathogenních kvasinek rodu Candida s potenciálními antimykotiky

Hodek Petr (PřF UK; petr.hodek@natur.cuni.cz)

DP1: Vývoj antibakteriálních protilátek pro pacienty s cystickou fibrosou

Hýsková Veronika (PřF UK, veronika.hyskova@natur.cuni.cz)

DP1: Charakterizace potyvirové proteasy (konzultant: Dr. T. Moravec)

Ječmen Tomáš (PřF UK, tomas.jecmen@natur.cuni.cz)

DP1: Vliv složení detritu na růst a vývoj kriticky ohrožené perlorodky říční (konzultant:Dr. K. Bělonožníková)

DP2: Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii

DP3: Exprese a purifikace mutantů cytochromu b₅ s nepřirozenými aminokyselinami (konzultant: Dr. V. Černá)

Jeřábek Petr (PřF UK, petr.jerabek@natur.cuni.cz)

DP1: Studium dynamiky přístupových tunelů k aktivnímu centru cytochromů P450 metodami molekulového modelování

Jiráček Jiří (ÚOCHB; jiracek@uochb.cas.cz)

DP1: Biologické vlastnosti konjugátů insulinu s N-acetylgalactosaminem 

Koblas Tomáš (IKEM; tokb@medicon.cz)

DP1: In vitro připrava modifikovaných mediátorových RNA kódujících regulátory buněčného cyklu pro účely stimulace proliferace pankreatických beta buněk

Kukačka Zdeněk (Biocev AV ČR v.v.i., zdenek.kukacka@biomed.cas.cz)

DP1: Strukturní charakterizace intermediálních filament pomocí moderních technik hmotnostní spektrometrie

Man Petr (AV ČR, v.v.i.; pman@biomed.cas.cz)

DP1: Studium struktury a dynamiky membránových transportérů.

Martínková Markéta (PřF UK, marketa.martinkova@natur.cuni.cz)

DP1: Identifikace nových zástupců hemových senzorových protein a jejich biochemická charakterizace DP2: Strukturně-funkční mechanismy modelových zástupců hemových senzorových proteinů

Novák Petr (PřF UK, petr.novák@natur.cuni.cz)

DP1: Příprava a charakterizace průtokových reaktorů pro validaci biologických léčiv

DP2: Příprava a charakterizace průtokových reaktorů pro validaci RNA vakcín

DP3: Mapování struktury nukleových kyselin pomocí radikálové chemie

Pompach Petr (Biocev AV ČR v.v.i.; petrpompach@gmail.com)

DP1: Příprava imunoafinitních čipů pro klinickou diagnostiku

Souček Pavel (SZÚ, pavel.soucek@szu.cz)

DP1: Studium faktorů korelujících s prognózou a výsledkem léčby ovariálního karcinomu

Šulc Miroslav (PřF UK; miroslav.sulc@natur.cuni.cz)

DP1: Využití nekanonických aminokyselin pro studium protein-proteinových interakcí modelového metaloproteinu azurinu (P. aeruginosa)

DP2: Studium proteinových interakcí lidského kalmodulinu s využitím nekanonických aminokyselin a strukturně-funkční proteomiky

Vaněk Ondřej (PřF UK, ondrej.vanek@natur.cuni.cz)

DP1: Strukturní imunologie NK buněčného rozpoznávání

DP2: Terapeutické využití vazebných domén a ligandů NK buněčných receptorů