Doc. RNDr. František Půta, CSc.

Kontaktní údaje

tel.: +420 22195 1777

FAX: +420 22195 1758

e-mail: puta@natur.cuni.cz

kancelář: Viničná 7, přízemí, dveře č. 43/44

konzultační hodiny: pátek 9:30-11:30

Profesní zkušenosti a současný výzkum
František Půta vystudoval obor genetika na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy v Praze v roce 1983. Během doktorského studia (1984-1990) na PřF UK v Praze (spec. genetika) se věnoval konstrukci plasmidových vektorů pro klonování kvasinkových genů. Vektory jím konstruované jsou vybaveny pozitivním selekčním systémem pro přímou selekci klonů transformovaných rekombinantními plasmidy. Od roku 1992 se věnuje výzkumu genové exprese, nejdříve na modelovém organismu Dictyostelium discoideum, následně na kvasinkách Schizosaccharomyces pombe a Saccharomyces cerevisiae. Ústředním tématem jeho současného výzkumu je role sestřihového faktoru SKIP/Prp45 ve spliceosomu, a výběr 3’ sestřihového místa.

Studijní pobyty
V roce 1988 absolvoval čtyřměsíční studijní pobyt na Moskevská státní universitě a Výzkumném ústavu pro genetiku v Moskvě. V roce 1993 se zúčastnil kurz EMBO na Institutu Maxe-Plancka v Martinsriedu u Mnichova. V roce 1994 mu byl udělen IREX award na čtyřměsíční studijní pobyt na City University v New Yorku. V roce 2003 získal stipendium  Alexander von Humboldt Stiftung na dvouměsíční studijní pobyt na Universitě v Kasselu.

Vědecká výchova

Během svého působení na fakultě se podílel na vedení sedmi úspěšně ukončených doktorských projektů:

RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (Ph.D. 2001); v letech 2001-2005 absolvoval postdoktorální pobyt na National Institutes of Health, Bethesda, USA; nyní docentem na katedře buněčné biologie PřF UK v Praze.

Mgr. Monika Ambrozková, Ph.D. (Ph.D. 2001)

RNDr. Michal Skružný, Ph.D. (Ph.D. 2003); po ukončení doktorského studia absolvoval postdoc na Biochemie-Zentrum, Universtät Heidelberg, SRN;  v European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Heidelberg, SRN, dnes působí na Univerzitě v Marburgu, SRN.

Mgr. Martin Převorovský, Ph.D. (Ph.D. 2009); po ukončení doktorského studia absolvoval postdoc v laboratoři Jürga Bählera na University College v Londýně; nyní působí jako odborný asistent na katedře buněčné biologie.

Mgr. Kateřina Abrhámová, Ph.D. (Ph.D. 2010); tč. vědecký pracovník na katedře buněčné biologie. 

Mgr. Ondřej Gahura, Ph.D. (Ph.D. 2012) ; vědecký pracovník na Parazitologickém ústavu JU České Budějovice. 

Mgr. Martina Oravcová (roz. Ptáčková), Ph.D. (Ph.D. 2014); tč. vědecký pracovník University of San Diego, California, USA.

Dále se podílel na výchově 23 diplomantů a 8 bakalářů (do r. 2011).

Spolupráce se zahraničím

Prof. W. Nellen, Universität Kassel, Německo
Prof. Christian Hammann, Technische Universität Darmstadt, Německo
Prof. Jürg Bähler, University College, Londýn, Velká Británie

Nejvýznamnější publikace

Wang X, Wu F, Xie Q, Wang H, Wang Y, Yue Y, Gahura O, Ma S, Liu L, Cao Y, Jiao Y, Puta F, McClung CR, Xu X, Ma L. (2012) SKIP Is a Component of the Spliceosome Linking Alternative Splicing and the Circadian Clock in Arabidopsis. Plant Cell. 24(8): 3278-3295. (IF=8.987)

Převorovský M, Atkinson SR, Ptáčková M, McLean JR, Gould K, Folk P, Půta F, Bähler J. (2011) N-Termini of Fungal CSL Transcription Factors Are Disordered, Enriched in Regulatory Motifs and Inhibit DNA Binding in Fission Yeast. PLoS One. 2011;6(8): e23650. (IF 4.411)

Gahura O, Hammann Ch, Valentová A, Půta F a Folk P (2011) Secondary structure is required for 3′ splice site recognition in yeast. Nucleic Acid Res. [Epub ahead of print] September 5 (IF 7.836)

Gahura O, Abrhámová K, Skružný M, Valentová A, Munzarová V, Folk P, Půta F (2009) Prp45 affects Prp22 partition in spliceosomal complexes and splicing efficiency of non-consensus substrates. J Cell Biochem. 106(1):139-151 (IF = 3.381; 2007)

Převorovský M, Groušl T, Staňurová J, Ryneš J, Nellen W, Půta F, Folk P (2009) Cbf11 and Cbf12, the fission yeast CSL proteins, play opposing roles in cell adhesion and coordination of cell and nuclear division. Exp. Cell Res. 315(8):1533-47. (IF= 3.695; 2007)

Převorovský M, Půta F, Folk P (2007) Fungal CSL transcription factors. BMC Genomics. 8:233-245. (IF = 4.180; 2007)

Folk P, Půta F, Skružný M (2004) Transcriptional coregulator SNW/SKIP: the concealed tie of dissimilar pathways. Cell. Mol. Life Sci. 61: 629-640. (IF 4,812; 2004)

Převorovský M, Půta F (2003) A/T-rich inverted DNA repeats are destabilized by chaotrope-containing buffer during purification using silica gel membrane technology. Biotechniques 35(4): 698-700. (IF 2,545; 2004)

Martínková K, Lebduška P, Skružný M, Folk P, Půta F (2002) Functional mapping of Saccharomyces cerevisiae Prp45 identifies the SNW domain as essential for viability. J. Biochem 132(4): 557-563. (IF 2,292; 2004)

Brábek J, Mojžita D, Novotný M, Půta F, Folk P (2002) The SH3 domain of Src can downregulate its kinase activity in the absence of the SH2 domain-pY527 interaction. Biochem. Biophys Research Commun. 296(3): 664-670. (IF 2,904; 2004)

Ambrozková M, Půta F, Fuková I, Hamplová L, Skružný M, Folk P (2001) The fission yeast ortholog of coregulator SKIP interacts with the small subunit of U2AF. Biochem. Biophys. Res. Commun. 284(5): 1148-1154. (IF 2,904; 2004)

Skružný M, Ambrozková M, Fuková I, Martínková K, Blahůšková A, Půta F, Folk P (2001) Cyclophilins of a novel subfamily interact with SNW/SKIP coregulator in D. discoideum and S. pombe. Biochim. Biophys. Acta 1521: 146-151. (IF 3,369; 2004)

Rősel D, Půta F, Blahůšková A, Smýkal P, Folk P (2000) Molecular characterization of a calmodulin-like Dictyostelium protein CalB. FEBS Lett. 473(3): 323-327. (IF 3,843; 2004)

Folk P, Půta F, Krpejšová L, Blahůšková A, Markoš A, Rabino M, Dottin RP (1996) The homolog of chromatin binding protein Bx42 identified in Dictyostelium. Gene 181: 229-231. (IF 2,705; 2004))