Hlavní směry výzkumu

Algologie

• Viz http://botany.natur.cuni.cz/algo/vyzkum.html
• Ekologie fytobentosu v rašeliništích
• Taxonomie, ekologie a biodiverzita chrysomonád (http://chrysophytes.eu/)
• Ekologie terestrických biofilmů
• Fenotypická plasticita a geometrická morfometrika mikrořas
• Ekofyziologie a stresová tolerance zelených řas
• Taxonomie a fylogenetika zelených aerofytických řas
• Evoluce a kryptická diverzita krásivek
• Molekulární diverzita a evoluce zlativek
• Druhový koncept, diverzita a ekologie lišejníkových fotobiontů
• Molekulární fylogenetika a ekologie rozsivek

Pavel Škaloud skaloud@natur.cuni.cz

Jiří Neustupa, Yvonne Němcová, Jana Kulichová, Jan Šťastný, Martina Pichrtová

Mykologie

• Viz http://botany.natur.cuni.cz/myko/index.research.html
• Endofytní houby listnatých dřevin
• Taxonomie a ekologie rzí
• Ekologie půdních hub na odkalištích a na extrémních stanovištích
• Biodiverzita pyrenomycetů
• Ekologie hub v jehličnatém opadu
• Diverzita a ekologie hub žijících v symbiózách s podkorním hmyzem
• Diverzita půdních hub na přirozených stanovištích (např. Šumava, Krkonoše)

Ondřej Koukol ondrej.koukol@natur.cuni.cz

Populační ekologie

• dynamika rostlinných populací, role jednotlivých složek jejich životního cyklu
• šíření rostlin v krajině a metapopulační dynamika, jak se rostliny vyrovnávají s měnící se krajinou
• interakce rostlin a opylovačů, herbivorů a patogenů a jejich vliv na život rostlin
• populační biologie invazních rostlin: hledání slabých míst v jejich životním cyklu pro jejich cílený management

Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz

Zdeněk Janovský, Tomáš Koubek, Tomáš Herben

Ochranářská biologie

• management přírodovědecky cenných území (kosení, pastva) a jeho vliv na biodiverzitu, návrhy managementových programů v chráněných územích
• cílená ochrana vzácných druhů: znalost jejich populační biologie a genetiky jako předpoklad pro úspěšnou ochranu

Zuzana Münzbergová zuzmun@natur.cuni.cz

Hana Mayerová, Věra Hadincová

Experimentální a evoluční ekologie

• chování rostlin a fenotypická plasticita: jak rostliny reagují na své sousedy, na herbivory a patogeny a na měnící se vnější prostředí
• vzájemné vztahy rostlinných jedinců v kompetici
• vegetativní/klonální růst jako klíčový životní projev rostlin, jeho možnosti a vztah k prostředí

Martin Weiser weiser2@natur.cuni.cz

Tomáš Koubek, Tomáš Herben

Historie a dynamika vegetace a krajiny

• lesní vegetace a její dynamika, vliv lesního hospodaření dnes a v minulosti
• jak dnešní vegetace odráží strukturu krajiny v minulosti, krajinná paměť a vegetace, využití historických map, starých leteckých snímků, paleoekologických dat, archivních záznamů
• sukcese v moderní krajině za poslední století, zpracování starých vegetačních záznamů, map a půdních analýz jako unkátních informací o minulé vegetaci, sukcese a obnova krajiny

Jaroslav Vojta jarvojta@natur.cuni.cz

Petr Sklenář, Pavel Kovář, Martin Kačmar, Martin Kopecký, Martin Macek, Radim Hédl, Jan Wild, Jiří Sádlo

Tropická ekologie

• ekologie jihoamerických parámos, příčiny jejich biodiverzity, evoluce a fylogeneze modelových skupin páramos
• fyziologická ekologie horských tropických rostlin, adaptace na teplotní extrémy

Petr Sklenář petr@natur.cuni.cz

Vojtěch Zeisek, Diana Libeth Aparicio Vásquez, Eva Dušková

Kvartérní paleoekologie

• dlouhodobá dynamika vegetace a kvantitativní rekonstrukce půdního krytu (land cover) v minulosti
• vliv změn klimatu a disturbance (požárů, land use) na vegetaci
• pylová analýza, rostlinné makrozbytky, analýza uhlíků, a další

Petr Kuneš petr@kunes.net

Petr Pokorný, Vojtěch Abraham, Přemysl Bobek

Biosystematika a evoluce rostlin

• Biosystematické studie polyploidních kompexů. Cílem projektů je nahlédnout do variability polyploidních skupin na různých hierarchických úrovních a poznat příčiny a důsledky této variability. Zabýváme se otázkami morfologické a ekologické diferenciace, geografického rozšíření, reprodukčních způsobů i vnitro- a mezipopulační genetické variability. Při studiu jsou používány soubory molekulárních technik, morfometrická hodnocení a cytometrické postupy. (http://www.ibot.cas.cz/fcm)
• Evoluční dynamika polyploidních skupin, procesy ve smíšených populacích více cytotypů (http://www.ibot.cas.cz/fcm) Cílem projektů je odhalit, jakou roli hrají vybrané mikroevoluční procesy při vzniku, uchycení a dalším šíření polyploidních taxonů. Zkoumána je role neredukovaných gamet, vznik a účinnost reprodukčně-izolačních mechanismů, stanovištní diferenciace, otázky vzájemného ovlivňování cytotypů (hybridizace, kompetice) a jejich interakcí s dalšími skupinami organismů (opylovači, herbivoři, mykorhizní houby). Zvláštní pozornost je věnována sympatrickým diploidně-polyploidním populacím, které představují počáteční stav v evoluci většiny polyploidů. Mezi nejčastější metodické přístupy patří cytometrické techniky, experimentální postupy a ekologická a fenologická pozorování.
• Fylogeografie polyploidních komplexů
• Systematika rodu Festuca v tropických Andách (http://botany.natur.cuni.cz/stancik/descriptions/descriptions.html)

Jan Suda suda@natur.cuni.cz

Výzkumné zaměření - hlavní obory rozvíjené na Katedře botaniky

• Ekologie, rozšíření, diverzita a taxonomie saprotrofních a parazitických hub, lišejníků a mechorostů v přirozených i umělých, antropicky zatížených ekosystémech.
• Role saprotrofních hub při dekompozici opadu a koloběhu živin v ekosystému.
• Mikroskopické houby významné v prostředí člověka, v potravinářství a ve zdravotnictví (alergenní mikromycety, klinicky významné houby).
• Interakce mikroskopických hub s jinými mikroorganismy (krytenky), členovci (pancířníci, dřevokazný hmyz) a dřevinami.
• Morfologie, taxonomie a ontogeneze vybraných skupin řas.
• Molekulární fylogenetika zelených řas.
• Ekologie a rozšíření planktonních a bentických řasových populací stojatých i tekoucích sladkých vod; ekologie synuzií půdních a aerických sinic a řas.
• Geometrická morfometrika v ekologii zelených řas a chrysomonád.
• Polyploidie a její role v evoluci cévnatých rostlin.
• Populační dynamika polyploidních komplexů.
• Mikroevoluční procesy v sympatických populacích různých cytotypů.
• Genetická variabilita vzácných a ohrožených druhů cévnatých rostlin.
• Apomiktické komplexy.
• Biosystematické studie cévnatých rostlin, s důrazem na zástupce střední Evropy a Středomoří.
• Fylogeografie a studium šíření.
• Fytogeografie území ČR.
• Morfologie cévnatých rostlin.
• Struktura, klasifikace a dynamika moderní vegetace.
• Změny vegetace v historické době.
• Dynamika ekosystémů v záplavových zónách řek.
• Populační biologie druhů a její role pro přežití druhů v krajině.
• Genetická variabilita rostlin ve vztahu k ekologii.
• Mechanismy určující druhovou bohatost rostlinných společenstev.
• Vztahy mezi rostlinami a živočichy, a dalšími skupinami organismů.
• Paleoekologie a archeobotanika středoevropské krajiny.
• Populační biologie vzácných a mizejících druhů naší květeny.
• Ekologie invazních druhů rostlin.
• Kolonizace a sukcese na nově vzniklých stanovištích.
• Tropická ekologie.