E-mail | SIS | Moodle | Helpdesk | Knihovny | cuni.cz | CIS Více

česky | english Přihlášení



Práce se softwarem pro analýzu gelů KODAK 1D Image Analysis Software

  • program umožňuje automatické vyhledání drah a proužků, po jejich srovnání se žebříčkem i určení velikosti proužků a koncentrace DNA v nich

  • nejprve tlačítkem Kodak - selection tool vybereme oblast gelu, kterou chceme analysovat

  • potom stiskneme „Find Lanes“, přes proužky příslušných drah se nakreslí čáry

  • pokud není automatické nalezení přesné, je možné udělat úpravy manuálně (pomocí tlačítka Kodak - sipka)

  • vybereme dráhu s žebříčkem a po dvojkliku na ní se objeví okno, ve kterém zadáme „Lane Type“ jako Standard, klikneme na „Select“ a vybereme příslušný žebříček

  • stiskneme „Find Bands“, objeví se čáry v místech, kde jsou proužky, citlivost vyhledávání proužků lze ovlivnit stiskem „Adjust Bands

  • přebytečné proužky lze smazat po jejich vybrání tlačítkem Kodak - sipka 

  • přidat proužky lze po stisku tlačítka Kodak - bands 

  • na velikosti proužků se můžeme podívat po stisku „Lane Analysis Data“ z menu „Options“, je možno vybrat zobrazení různých charakteristik proužků, důležitá je především délka proužku (MW – molecular weight udávaná v bp, tj. base pairs, počet párů bazí) a množství DNA (Mass v ng)

  • pro další funkce programu viz User´s Guide

Akce dokumentů