Alena Kubátová

VĚDECKÝ PROFIL A ZAMĚŘENÍ

• Taxonomie a ekologie saprotrofních mikroskopických hub (Eurotiales, Hypocreales aj.)
• Biodiverzita mikroskopických hub přírodních i antropogenních stanovišť (půda, hmyz aj.)
• Environmentální mykologie (mikroskopické houby v prostředí člověka: toxinogenní a alergenní mikromycety, příležitostně patogenní mikroskopické houby)
• Rody Penicillium a Aspergillus

Atlasy mikroskopických hub

Atlas zygomycetů (2009)

Atlas mikroskopických saprotrofních hub (Ascomycota) (2006)

Miniatlas mikroorganismů (2001)

PEDAGOGICKÁ ČINNOST

• Botanika pro ÚŽP MB120P43A, 3/2
• Mykologie (pro učitele) MB120P124 2/0
• Cvičení z mykologie (pro učitele) MB120P127 0/1
• Speciální mykologie I. MB120P47, 3/3
• Speciální mykologie II.  MB120P90, 3/3
• Toxinogenní mikromycety MB120P101, 1/1
• Univerzita III. věku - Přednáška o mikromycetech a jejich toxinech

Školitel postgraduálních prací

• Hujslová M. (2015): Biodiverzita a taxonomie mikroskopických půdních hub v extrémně kyselých zasolených půdách přirozeně vzniklých a antropogenních stanovišť v ČR

Školitel diplomových prací

• Homutová K. (2014): Ekofyziologie mikroskopické houby Pseudogymnoascus destructans.
• Valinová Š. (2013): Diverzita a taxonomie rodu Trichoderma v České republice.
• Bukovská P. (2009): Dekompozice listového opadu mikroskopickými houbami na antropogenních stanovištích.
• Hujslová M. (2006): Půdní saprotrofní mikroskopické houby extrémních stanovišť (na příkladu NP Soos). - 116 p.
• Nová - Harásková L. (2005): Kontaminace potravin rostlinného původu mikroskopickými houbami. – 70 p.
• Slezáková L. (2004): Toxinogenní mikromycety na transgenních a netransgenních hybridech kukuřice. – 133 p.
• Strnadová V. (2002): Kontaminace čajů mikroskopickými houbami. – 87 p.
• Kolařík M. (2002): Ekologie a taxonomie hypokreálních zástupců rodu Geosmithia. – 152 p.
• Patáková J. (1997): Studium mikromycetů v aspirabilní frakci prašného aerosolu v ovzduší Prahy. - 109 p.
• Kolínská R. (1996): Mikroskopické houby kontaminující sušené mléčné výrobky. - 87 p.

PUBLIKACE

• Crous P.W. et al. (2022): Fungal Planet description sheets: 1383–1435. Persoonia 48: 261–371. [Sheet 1421 Penicillium neoherquei]

• Komínek et al. (2021): Metodika identifikace chybějících genetických zdrojů ve sbírkách mikroorganismů a strategie zaplnění zjištěných mezer. – VÚRV Praha, 65 p. ISBN 978-80-7427-353-7

• Kubátová A., Hubka V. (2021): Records of the rare and extremely osmophilic fungi Penicillium eremophilum and Xerochrysium dermatitidis on soy bars. – Czech Mycol. 73(2): 185–198. 

• Kubátová A., Hubka V. (2021): Triadelphia morgoensis, an enigmatic wood-associated hyphomycete: second record, updated description and molecular identification. – Czech Mycol. 73(2): 173–184. 

• Labuda R., Bacher M., Rosenau T., Gasparotto E., Gratzl H., Doppler M., Sulyok M., Kubátová A., Berger H., Cank K., Raja H.A., Oberlies N.H., Schüller C., Strauss J. (2021): Polyphasic approach utilized for the identification of two new toxigenic members of Penicillium section Exilicaulis, P. krskae and P. silybi spp. nov. - J. Fungi 7: 557. 

• Crous P.W. et al. (2021): Fungal Planet description sheets: 1182–1283. Persoonia 46: 313–528. [Sheet 1227 Arcopilus navicularis, sheet 1281 Xerochrysium bohemicum] 

• Labuda R., Bernreiter A., Hochenauer D., Kubátová A., Kandemir H., Schüller C. (2021): Molecular systematics of Keratinophyton: the inclusion of species formerly referred to Chrysosporium and description of four new species. IMA Fungus 12:17.  

• Sklenář F., Jurjević Ž., Peterson S.W., Kolařík M., Nováková A., Flieger M., Stodůlková E., Kubátová A., Hubka V. (2020): Increasing the species diversity in the Aspergillus section Nidulantes: Six novel species mainly from the indoor environment. Mycologia 112: 342-370.

• Řehulka J., Kubátová A., Hubka V. (2020): Swim bladder mycosis in farmed rainbow trout Oncorhynchus mykiss caused by Phoma herbarum and experimental verification of pathogenicity. Diseases of Aquatic Organisms 138: 237-246. 

• Ren P., Rajkumar S.S., Zhang T., Sui H., Masters P.S., Martínková N., Kubátová A., Pikula J. Chaturvedi S, Chatruvedi V. (2020): A common partitivirus infection in United States and czech Republic isolates of bat white-nose syndrome fungal pathogen Pseudogymnoascus destructans. Scientific Reports 10:13893.

• Veselská T., Homutová K., Fraile P.G., Kubátová A., Martínková N., Pikula J., Kolařík M. (2020): Comparative eco-physiology revealed extensive enzymatic curtailment, lipases production and strong conidial resilience of the bat pathogenic fungus Pseudogymnoascus destructans. Scientific Reports 10:16530.

• Daly J.-A., Hubka V., Kubátová A., Gimeno M., Barrs V.R. (2020): Feline disseminated cutaneous phaeohyphomycosis due to Exophiala spinifera. – Medical Mycology Case Reports 27: 32-35.
• Crous P.W., Wingfield M.J., Lombard L. et al. [incl. Kubátová A.] (2019): Fungal Planet description sheets: 951-1041. – Persoonia 43: 223-425. [Sheet 1035, p. 409-409, Talaromyces guatemalensis] 
• Labuda R., Bernreiter A., Hochenauer D., Schüller C., Kubátová A., Strauss J., Wagner M. (2019): Saksenaea dorisiae sp. nov., a new opportunistic pathogenic fungus from Europe. – International Journal of Microbiology, 2019: ID 6253829, 11 pages
• Shrestha B., Kubátová A., Tanaka E., Oh J., Yoon D.-H., Sung J.-M., Sung G.-H. (2019): Spider-pathogenic fungi within Hypocreales (Ascomycota): their current nomenclature, diversity, and distribution. – Mycological Progress 18: 983-1003.
• Kubátová A., Hujslová M., Frisvad J. C., Chudíčková M., Kolařík M. (2019): Taxonomic revision of the biotechnologically important species Penicillium oxalicum with the description of two new species from acidic and saline soils. – Mycological Progress 18: 215-228.
• Kubátová A., Hubka V. (2018): Nález koprofilní houby Penicillium paradoxum na Křivoklátsku. - Mykologické listy, no. 141: 24-32.
• Nováková A., Kubátová A., Sklenář F., Hubka V. (2018): Microscopic fungi on cadavers and skeletons from cave and mine environments. – Czech Mycol. 70(2): 101–121.
• Crous P.W., Wingfield M.J., Burgess T.I. et al. [incl. Kubátová A.] (2018): Fungal Planet description sheets: 716–784. – Persoonia 40: 240-393. [Sheet 734 and 735, p. 290-293, Lecanicillium]
• Řehulka J., Kubátová A., Hubka V. (2018): Swim bladder mycosis in pretty tetra (Hemigrammus pulcher) caused by Exophiala pisciphila and Phaeophleospora hymenocallidicola, and experimental verification of pathogenicity. – J. Fish Dis. 41:487–500. https://doi.org/ 10.1111/jfd.12750 1
• Labuda R., Bernreiter A., Schüller C., Kubátová A., Hellinger R., Strauss J. (2018): Metapochonia lutea, a new species isolated from the Danube river in Austria. – Nova Hedwigia 107(3-4): 487-500.
• Hubka V., Barrs V., Dudová Z., Sklenář F., Kubátová A., Matsuzawa T., Yaguchi T., Horie Y., Nováková A., Frisvad J. C., Talbot J. J., Kolařík M. (2018): Unravelling species boundaries in the Aspergillus viridinutans complex (section Fumigati): opportunistic human and animal pathogens capable of interspecific hybridization. – Persoonia 41: 142–174.
• Hujslová M., Kubátová A., Bukovská P., Chudíčková M., Kolařík M. (2017): Extremely acidic soils are dominated by species-poor and highly specific fungal communities. – Microb. Ecol. 73: 321–337.
• Kolařík M., Spakowicz D. J., Gazis R. et al. [incl. Kubátová A.] (2017): Biatriospora (Ascomycota: Pleosporales) is an ecologically diverse genus including facultative marine fungi and endophytes with biotechnological potential. – Plant Syst. Evol. 303: 35–50. doi:10.1007/s00606-016-1350-2
• Hubka V., Dudová Z., Kubátová A., Frisvad J. C., Yaguchi T., Horie Y., Jurjević Ž., Hong S.-B., Kolařík M. (2017): Taxonomic novelties in Aspergillus section Fumigati: A. tasmanicus sp. nov., induction of sexual state in A. turcosus and overview of related species. – Plant. Syst. Evol. 303: 787-806.
• Chen A. J., Hubka V., Frisvad J. C., Visagie C. M., Houbraken J., Meijer M., Varga J., Demirel R., Jurjević Ž., Kubátová A., Sklenář F., Zhou Y. G., Samson R. A. (2017): Polyphasic taxonomy of Aspergillus section Aspergillus (formerly Eurotium), and its occurrence in indoor environments and food. – Stud. Mycol. 88: 37–135.
• Crous P. W., Wingfield M. J., Burgess T. I. et al. (2017): Fungal Planet description sheets: 558–624. – Persoonia 38: 240–384. [Sheet 605, p. 342-343, Myotisia]
• Hubka V., Nováková A., Peterson S. W., Frisvad J. C., Sklenář F., Matsuzawa T., Kubátová A., Kolařík M. (2016): A reappraisal of Aspergillus section Nidulantes with descriptions of two new sterigmatocystin-producing species. – Plant Syst. Evol. 302: 1267-1299.
• Řehulka J., Kubátová A., Hubka V. (2016): Cephalotheca sulfurea (Ascomycota, Sordariomycetes), a new fungal pathogen of the farmed rainbow trout Oncorhynchus mykiss. – Journal of Fish Diseases 39: 1413–1419.
• Zukal J., Bandouchova H., Brichta J., Cmokova A., Jaron K. S., Kolarik M., Kovacova V., Kubátová A., Nováková A., Orlov O., Pikula J., Presetnik P., Šuba J., Zahradníková A. Jr., Martínková N. (2016): White-nose syndrome without borders: Pseudogymnoascus destructans infection tolerated in Europe and Palearctic Asia but not in North America. – Sci. Rep. 6: 19829; doi: 10.1038/srep19829.
• Zukal J., Bandouchova H., Brichta J., Cmokova A., Jaron K. S., Kolarik M., Kovacova V., Kubátová A., Nováková A., Orlov O., Pikula J., Presetnik P., Šuba J., Zahradníková A. Jr., Martínková N. (2016): Corrigendum: White-nose syndrome without borders: Pseudogymnoascus destructans infection tolerated in Europe and Palearctic Asia but not in North America. – Sci. Rep. 6: 26049;  doi:  10.1038/srep26049
• Stodůlková E., Man P., Kuzma M., Černý J., Císařová I., Kubátová A., Chudíčková M., Kolařík M., Flieger M. (2015): A highly diverse spectrum of naphthoquinone derivatives produced by the endophytic fungus Biatriospora sp. CCF 4378. – Folia Microbiologica 60: 259-267.
• Nováková A., Sedlák P., Kubátová A., Tomšovský M. (2015): Underground spaces as neglected niche for occurrence of Heterobasidion annosum complex. – Forest Pathology 45: 373-378. doi: 10.1111/efp.12177
• Hubka V., Nissen C. V., Jensen R. H., Arendrup M. C., Cmokova A., Kubátová A., Skorepova M., Kolarik M. (2015): Discovery of a sexual stage in Trichophyton onychocola, a presumed geophilic dermatophyte isolated from toenails of patients with a history of T. rubrum onychomycosis. – Medical Mycology 53: 798-809.
• Jurjević Ž., Kubátová A., Kolařík M., Hubka V. (2015): Taxonomy of Aspergillus section Petersonii sect. nov. encompassing indoor and soil-borne species with predominant tropical distribution. – Plant Systematics and Evolution 301: 2441-2462.
• Holý O., Matoušková I., Kubátová A., Hamal P., Svobodová L., Jurásková E., Raida L. (2015): Monitoring of microscopic filamentous fungi in indoor air of transplant unit. – Cent. Eur. J. Public Health 23(4): 331-334.
• Palmer J. M., Kubatova A., Novakova A., Minnis A. M., Kolarik M. Lindner D. L. (2014): Molecular characterization of a heterothallic mating system in Pseudogymnoascus destructans, the fungus causing white-nose syndrome of bats. – G3: Genes/Genomes/Genetics 4: 1755-1763 DOI: 10.1534/g3.114.012641
• Semerád M., Čerňanský S., Šimonovičová A., Kubátová A., Takáčová A. (2014): Lúhovanie hliníka a medi z elektroodpadu. – In: Smolinská M., Melník M. (eds.), Priemyselná toxikológia 2014. Zborník príspevkov, p. 331-334.
• Nováková A., Dudová Z., Matsuzawa T., Kubátová A., Yaguchi T., Kolařík M. (2014): New species in Aspergillus section Fumigati  from reclamation sites in Wyoming (USA) and revision of A. viridinutans complex. – Fungal Diversity 64(1): 253-274. DOI:10.1007/s13225-013-0262-5
• Buchta V., Feuermannová A., Váša M., Bašková L., Kutová R., Kubátová A., Vejsová M. (2014): Outbreak of fungal endophthalmitis due to Fusarium oxysporum following cataract surgery. – Mycopathologia 177: 115-121. DOI:10.1007/s11046-013-9721-5
• Hujslová M., Kubátová A., Kostovčík M., Blanchette R. A., de Beer Z. W., Chudíčková M., Kolařík M. (2014): Three new genera of fungi from extremely acidic soils. – Mycological Progress 13: 819–831.
• Hujslová M., Kubátová A., Kostovčík M., Kolařík M. (2013): Acidiella bohemica gen. et sp. nov. and Acidomyces spp. (Teratosphaeriaceae), the indigenous inhabitants of extremely acidic soils in Europe. – Fungal Diversity 58: 33-45. DOI: 10.1007/s13225-012-0176-7
• Hubka V., Peterson S. W., Frisvad J. C., Yaguchi T., Kubátová A., Kolařík M. (2013): Aspergillus waksmanii sp. nov. and Aspergillus marvanovae sp. nov., two closely related species in section Fumigati. – International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 63: 783-789. DOI 10.1099/ijs.0.047076-0
• Hubka V., Kolařík M., Kubátová A., Peterson S. W. (2013): Taxonomic revision of Eurotium and transfer of species to Aspergillus. – Mycologia 105(4): 912-937.
• Hubka V., Dobiasova S., Lyskova P., Mallatova N., Chlebkova J., Skorepova M., Kubatova A., Dobias R., Chudickova M., Kolarik M. (2013): Auxarthron ostraviense sp. nov., and A. umbrinum associated with non-dermatophytic onychomycosis. - Medical Mycology 51: 614-524.
• Kubátová A. (2013): I plísně mohou být krásné. – Přírodovědci 2(2): 36-37.
• Klempova T., Basil E., Kubatova A., Certik M. (2013): Biosynthesis of gamma-linolenic acid and beta-carotene by Zygomycetes fungi. – Biotechnology Journal 8: 794-800.
• Lysková P., Žáčková P., Petečuková V., Hubka V., Vašáková M., Matěj R., Čermák J., Kubátová A., Kolařík M., Kozák T., Hricíková I. (2013): Plicní mukormykóza vyvolaná Rhizopus microsporus. – Klinická mikrobiologie a infekční lékařství 19(4): 132-137.
• Kubátová A. (2013): Jubileum Marie Váňové – 70 let. – Mykologické Listy no. 126: 34-36.
• Kubátová A. (2013): Velký úspěch naší mykologie: Mikroskopická houba Ochroconis lascauxensis je uvedena na seznamu "Top 10 New Species 2013". – Mykologické Listy no. 126: 33.
• Hubka V, Kubatova A, Mallatova N, Sedlacek P, Melichar J, Skorepova M, Mencl K, Lyskova P, Sramkova B, Chudickova M, Hamal P, Kolarik M. (2012): Rare and new aetiological agents revealed among 178 clinical Aspergillus strains obtained from Czech patients and characterised by molecular sequencing. – Medical Mycology 50:601–610. DOI: 10.3109/13693786.2012.667578
• Chrenková V., Kubátová A., Kolařík M., Vávra V., Nyč O., Sedláček P. (2012): Pneumonie způsobená houbou Hormographiella verticillata u dítěte s akutní leukémií. – Postgraduální medicína 14, Příloha 51-53.
• Kubátová A. (2012): Houby v našich domácnostech aneb o čem doma víte i nevíte. – Živa 60(5): 224-228.
• Hujslová M., Kubátová A., Kostovčík M., Kolařík M. (2012): Acidiella bohemica gen. et sp. nov. and Acidomyces spp. (Teratosphaeriaceae), the indigenous inhabitants of extremely acidic soils in Europe. - Fungal Diversity DOI 10.1007/s13225-012-0176-7
• Kotlaba F., Kubátová A. (2012): Za mykoložkou doc. RNDr. Olgou Fassatiovou, CSc. – Mykologické Listy 120: 32-34.
• Nováková A., Šimonovičová A., Kubátová A. (2012): List of cultivable microfungi recorded from soils, soil related substrates and underground environment of the Czech and Slovak Republics. – [Link page – Mycotaxon 119: 593]; 189 pp.
• Pažoutová S., Šrůtka P., Holuša J., Chudíčková M., Kubátová A., Kolařík M. (2012): Liberomycesgen. nov. with two new species of endophytic coelomycetes from broad-leaved trees. – Mycologia 104(1): 198-210.  DOI 10.3852/11-081
• Kubátová A., Koukol O., Nováková A. (2011): Geomyces destructans, phenotypic features of some Czech isolates. - Czech Mycology 63(1): 65-75.
• Mogensen J. M., Møller K.A., Freiesleben P. von, Labuda R., Varga E., Sulyok M., Kubátová A., Thrane U., Andersen B., Nielsen K.F. (2011): Production of fumonisins B₂ and B₄ in Tolypocladium species. - Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 38: 1329-1335. DOI 10.1007/s10295-010-0916-1
• Martínková N., Bačkor P., Bartonička T., Blažková P., Červený J., Falteisek L., Gaisler J., Hanzal V., Horáček D., Hubálek Z., Jahelková H., Kolařík M., Korytár Ľ., Kubátová A., Lehotská B., Lehotský R., Lučan R. K., Májek O., Matějů J., Řehák Z., Šafář J., Tájek P., Tkadlec E., Uhrin M., Wagner J., Weinfurtová D., Zima J., Zukal J. and Horáček I. (2010): Increasing incidence of Geomyces  destructans fungus in bats from the Czech Republic and Slovakia. – PLoS ONE 5(11): e13853. DOI 10.1371/journal.pone.0013853
• Kubátová A. (2010): Collection of food relevant microscopic fungi under the Czech National Programme of Protection of Genetic Resources of Economically Significant Microorganisms - A short report. - Czech Journal of Food Sciences 28(1): 79-82.
• Hujslová M., Kubátová A., Chudíčková M., Kolařík M. (2010): Diversity of fungal communities in saline and acidic soils in the Soos National Natural Reserve, Czech Republic. - Mycological Progress 9: 1-15. DOI 10.1007/s11557-009-0611-7
• Kubátová A. (2009): Významné životní jubileum doc. Olgy Fassatiové – 85 let. – Mykologické listy 109: 30-31.
• Kubátová A., Kolařík M., Jablonský I. (2009): Trichoderma aggressivum – první nález v České republice. – Mykologické listy 109: 18-24.
• Kubátová A., Váňová M. (2009): Pilotní průzkum půdních mikromycetů travinných společenstev v Národním parku Nízké Tatry. – In: Nováková A. (Ed.), Sborník příspěvků z mezinárodního semináře Život v půdě X., České Budějovice, 27.-28.1.2009, p. 103-107, ÚPB BC AV ČR, v.v.i., České Budějovice.
• Neustupa J., Škaloud P., Peksa O., Kubátová A., Soldán Z, Černá K., Prášil K., Bukovská P., Vojta J., Pažoutová M., Veselá J., Škaloudová M. (2009): The biological soil crusts in Central European ecosystems, with special reference to taxonomic structure and ecology of the surface crusts at Czech ore-waste and ash-slag sedimentation industrial basins. – Novit. Bot. Univ. Carol. 19/2008: 1-99.
• Kubátová A. (2008): Nejnovější poznatky v taxonomii rodu Aspergillus (minireview zaměřené na rostoucí druhovou diversitu). [News in the taxonomy of Aspergillus (minireview dealing with increasing species diversity)]. - In: Nováková A. (ed.): Sborník příspěvků z workshopu MICROMYCO 2007, 2.-3.září 2008, České Budějovice, p. 29-38.
• Kolařík M., Kubátová A., Hulcr J., Pažoutová S. (2008): Geosmithia fungi are highly diverse and consistent bark beetle associates: Evidence from their community structure in temperate Europe. – Microbial Ecology 55: 65-80.
• Kubátová A., Prášil K. (2008): Biologické půdní krusty jako prostředí pro život mikroskopických hub [Biological soil crusts as milieu of microscopic fungi]. - In: Ďugová O. (ed.), Život v pôde IX., Zborník referátov z medzinárodného seminára, 30.-31. januára 2008, Bratislava, p. 71-86, ÚKE SAV Bratislava.
• Varga J., Koncz Z., Kocsubé S., Mátrai T., Téren J., Ostrý V., Skarkova J., Ruprich J., Kubatova A., Kozakiewicz Z. (2007): Mycobiota of grapes collected in Hungarian and Czech vineyards in 2004. – Acta Alimentaria 36(3): 329-341.
• Ostrý V., Škarková J., Procházková I., Kubátová A., Malíř F., Ruprich J. (2007): Mycobiota of Czech wine grapes and occurrence of ochratoxin A and Alternariamycotoxins in fresh grape juice, must and wine. – Czech Mycology 59(2): 241-254.
• Kubátová A., Váňová M. (2007): Půdní mikromycety na vybraných lokalitách v Krkonoších – pilotní průzkum [Soil micromycetes on selected localities in the Giant Mountains – pilot study]. – In: Štursa J. et Knapik R. (eds.), Geoekologické problémy Krkonoš. Sborn. Mez. Věd. Konf., říjen 2006, Svoboda n. Úpou. Opera Corcontica 44/1: 265-269.
• Kubátová A., Prášil K., Dobiášová S. (2007): Oportunně patogenní vláknité mikromycety ve Sbírce kultur hub (CCF) v Praze. – In: Nováková A. (ed.): Sborník příspěvků z workshopu MICROMYCO 2007, 4.-5.září 2007, České Budějovice, p. 40-51.
• Kubátová A., Muzikář V. (2007): Opomíjené houbové kontaminanty potravin: Eurotium, Talaromyces a Chrysosporium [Neglected fungal contaminants of foods: Eurotium, Talaromyces and Chrysosporium]. – In: Demnerová K., Pazlarová J., Pazlar V. (eds.), Sborník ze semináře Mikrobiologie potravin, p. 60-65, VŠCHT v Praze & Českosl. Spol. Mikrobiol., Praha.
• Kubátová A., Kolařík M. (2007): Culture Collection of Fungi (CCF) in Prague – original isolates accessed during 2003-05. – Novit. Bot. Univ. Carol. 18: 91-111.
• Hujslová M., Kubátová A., Kolařík M., Chudíčková M. (2007): Mikroskopické houby extrémně kyselých zasolených půd [Soil micromycetes in extremely acid saline soils]. – In: Nováková A. (ed.): Sborník příspěvků z workshopu MICROMYCO 2007, 4.-5.září 2007, České Budějovice, p. 16-23.
• Homolka L., Lisá L., Kubátová A., Váňová M., Janderová B., Nerud F. (2007): Cryopreservation of filamentous micromycetes and yeasts using perlite. – Folia Microbiol. 52(2): 153-157.
• Matoušková I., Hamal P., Raclavský V., Vacková M., Buchta V., Kubátová A., Faber E. (2006): Třístupňová filtrace zajistí přívod vzduchu do izolačních pokojů bez mikrobiální kontaminace. - Hygiena 51/2006 (3-4):87-93.
• Dobiášová S., Klečka P., Kubátová A., Slezáček I., Dobiáš R. (2006): Pansinusitida mykotické etiologie. – Zpravodaj Zdravotního ústavu Ostrava 2(4): 6-7.
• Slezáková L., Kubátová A. (2006): Toxigenic micromycetes and their mycotoxins associated with transgenic Bt-maize and nontransgenic hybrids of maize. – In: Řehout V. [ed.], Biotechnology 2006, p. 727-729, Sci. Pedag. Publ., České Budějovice.
• Kubátová A. (2006): Chaetomium in the Czech Republic and notes to three new records. – Czech Mycol. 58(3-4): 155-171.
• Hujslová M., Kubátová A., Kolařík M. (2006): Halofilní a acidofilní společenstva půdních hub v podmínkách mírného pásu - NPR Soos, ČR [Halophilic and acidophilic fungi in temperate region – an example of National Natural Reserve "Soos", Czech Republic]. – In: Šimonovičová A., Dlapa P., Mičuda R. [eds.], Život v pôde VII. [Life in Soil VII], p. 104-122, UK v Bratislavě.
• Vackova M., Buchta V., Prymula R., Cerman J., Kubatova A., Hamal P., Raclavský V., Chlibek R. (2006): The occurrence of microscopic fungi in air samples from a Transplant Intensive Care Unit. – Indoor Built Environ. 15(1): 115-118.
• Kubátová A., Dvořák L. (2005): Entomopathogenic fungi associated with insect hibernating in underground shelters. – Czech Mycology 57(3-4): 221-237.
• Kolařík M., Kubátová A., Čepička I., Pažoutová S., Šrůtka P. (2005): A complex of three new white-spored, sympatric, and host range limited Geosmithia species. – Mycol. Res. 109(12): 1323-1336.
• Řezáčová V., Kubátová A. (2005): Saprobic microfungi in tea based on Camellia sinensis and on other dried herbs. – Czech Mycology 57(1-2): 79-89.
• Stejskal V., Hubert J., Kubátová A., Váňová M. (2005): Fungi associated with rodent feces in stored grain environment in the Czech Republic. – Zeitschrift fűr Pflanzenkrankheiten und Pflanzenschutz 112(1): 98-102.
• Čížková D., Šrůtka P., Kolařík M., Kubátová A., Pažoutová S. (2005): Assessing the pathogenic effect of Fusarium, Geosmithia andOphiostoma  fungi from a broad-leaved trees. – Folia Microbiol. 50(1): 59-62.
• Ostrý V., Škarková J., Kubátová A., Procházková I., Ruprich J., Vajčner P., Matula K. (2005): Réva vinná, toxinogenní vláknité mikroskopické houby a ochratoxin A (II.). Vinařský obzor 98(7-8): 389-391. [In Czech]
• Kubátová A., Prášil K., Váňová M. (2005): Půdní mikromycety v prostředí podzemního ltunelu – předběžné výsledky [Soil micromycetes in the environment of underground tunnel – preliminary results]. – In: Voříšek K. et al. [eds.], Život v pode VI, p. 91-98, ČZU v Praze.
• Váňová M., Kubátová A. (2004): Dung microcosms as another source of fungal biodiversity on areas with industrial deposits. - In: Kovář P. (ed.), Natural Recovery of Human-Made Deposits in Landscape (Biotic Interactions and Ore/Ash-Slag Artificial Ecosystems), Academia, Prague, p. 121-131. ISBN 80-200-1279-6
• Hubert J., Stejskal V., Munzbergová Z., Kubátová A., Vánová M., Ždárková E. (2004): Mites and fungi in heavily infested stores in the Czech Republic. – J. Econ. Entomol. 97(6): 2144-2153.
• Kubátová A. (2004): To the 80th birthday of Olga Fassatiová. - Czech Mycol. 56(3-4): 179-183.
• Kubátová A. (2004): The arachnogenous fungus Gibellula leiopus – second find from the Czech Republic. – Czech Mycol. 56(3-4): 185-191.
• Kolařík M., Kubátová A., Pažoutová S., Šrůtka P. (2004): Morphological and molecular characterisation of Geosmithia putterillii, G. pallida comb. nov. and G. flava sp. nov., associated with subcorticolous insects. – Mycol. Res. 108(9): 1053-1069.
• Kubátová A., Kolařík M., Prášil K., Novotný D. (2004): Bark beetles and their galleries: well-known niches for little known fungi on the example of Geosmithia. – Czech Mycology 56(1-2): 1-18.
• Kubátová A., Kolařík M., Pažoutová S. (2004): Phaeoacremonium rubrigenum – hyphomycete associated with bark beetles found in Czechia. – Folia Microbiol. 49(2): 99-104. http://dx.doi.org/10.1007/BF02931381
• Hubert J., Jarošík V., Mourek J., Kubátová A., Žďárková E. (2004): Astigmatid mite growth and fungi preference (Acari: Acaridida): Comparisons in laboratory experiments. – Pedobiologia 48: 205-214.
• Dobiášová S., Kolčáková J., Kubátová A. (2003): Fungal infections identified in AIDS patients. – In: Trends in Medical Mycology, p. 193-196. ISBN 88-323-3154-3
• Kubátová A., Váňová M., Prášil K. (2003): CCF Catalogue of filamentous fungi. 5th ed. – Novit. Bot. Univ. Carol. 16/2002: 5-137.
• Kubátová A. (2003): Nové změny v taxonomii rodu Verticillium: Revize sekce Prostrata.[New changes in taxonomy of Verticillium section Prostrata] – Mykol. Listy, Praha, No. 84-85: 38-47.
• Hubert J., Stejskal V., Kubátová A., Munzbergová Z., Váňová M., Žďárková E. (2003): Mites as selective fungal carriers in stored grain habitats. - Experimental and Applied Acarology 29(1): 69-87.
• Stejskal V., Hubert J., Kubátová A. (2002): Associated-Food-Hazards: Storage fungi and mites in poppy, mustard, lettuce and wheat. – Plant Protection Science 38(2): 673-680.
• Kubátová A., Novotný D. & Prášil K. (2002): Microscopic fungi associated with oak bark beetle (Scolytus intricatus) in the Czech Republic. – In: IMC 7 Book of abstracts, The 7th International Mycological congress, Oslo 11-17 August 2002, p. 300.
• Kubátová A., Prášil K. & Váňová M. (2002): Diversity of soil microscopic fungi on abandoned industrial deposits. - Cryptogamie, Mycologie 23 (3): 205-219.
• Ostry V., Ruprich J., Skarkova J., Prochazkova I. & Kubatova A. (2002): MYKOMON – monitoring project of toxigenic fungi in food in years 1999-2001. – Mycotoxin Research 18A(2): 193-197.
• Chumchalová J., Němec M., Kotoučková L., Páčová Z., Savická D., Kubátová A. & Patáková P. (2001): Miniatlas mikroorganismů. CD http://www.vscht.cz/obsah/fakulty/fpbt/ostatni/miniatlas/index.htm
• Kubátová A. & Kolínská R. (2001): Microfungi contaminating dried foods in the Czech Republic. – In: Logrieco A. (ed.), Occurrence of toxigenic fungi and mycotoxins in plants, food and feed in Europe, COST Action 835, p. 19-24.
• Kubátová A. & Váňová M. (2001): Present state of research on soil microfungi of the Bohemian Forest (Šumava Mts.). – Silva Gabreta 7: 165-176.
• Kubátová A., Černý M. & Nováková A. (2001): New records of micromycetes from the Czech Republic. IV. Acrodontium salmoneum, Chaunopycnis alba and Cylindrocarpostylus gregarius, and notes on Dactylaria lanosa and Trichoderma saturnisporum. – Czech Mycol. 53(3): 237-255.
• Ostry V., Ruprich J., Skarkova J., Prochazkova I. & Kubatova A. (2001): The system approach to the identification of aflatoxigenic fungi in foodstuffs and feedstuffs. – Mycotoxin Research 17 A(2): 178-182.
• Váňová M. & Kubátová A. (2001): Příspěvek k poznání koprofilních hub na Šumavě [Contribution to the knowledge of coprophilous fungi in the Bohemian Forest (the Šumava Mts.)]. - Silva Gabreta 7: 191-198.
• Hubert J., Kubátová A. & Šárová J. (2000): Feeding of Scheloribates laevigatus (Acari: Oribatida) on different stadia of decomposing grass litter (Holcus lanatus). – Pedobiologia 44: 627-639.
• Kubátová A. (2000): Neglected Penicillium spp. associated with declining trees. – In: Samson R. A. & Pitt J. I. [eds.], Integration of modern taxonomic methods for Penicillium and Aspergillus classification, p. 299-307, Harwood Academic Publishers.
• Kubátová A. (2000): Nové druhy toxinogenních penicilií nalezené na potravinách a jejich identifikace [New species of toxigenic Penicillia and their identification]. – In: Muzikář V. & Bartl V., Aktuální problematika mikrobiologie potravin - II, p. 103-107, Praha.
• Kubátová A., Novotný D., Prášil K. & Mráček Z. (2000): The nematophagous hyphomycete Esteya vermicola found in the Czech Republic. – Czech Mycol. 52(3): 227-235.
• Kubátová A., Váňová M., Prášil K. & Fassatiová O. (2000): Microfungi contaminating foods with low water content. – Novit. Bot. Univ. Carol., 13/1999: 13-25.
• Ostrý V., Ruprich J., Procházková I., Škarková J. & Kubátová A. (2000): MYKOMON, project for the determination and the identification of toxigenic fungi in food in the Czech Republic. – In: Grajewski J. [ed.], 5th International conference mycotoxins and dioxins and the environment, Bydgoszcz, 25-27 September 2000, p. 191-196.
• Huňková Z., Kubátová A., Weignerová L. & Křen V. (1999): Induction of extracellular glycosidases in filamentous fungi and their potential use in chemotaxonomy. – Czech Mycol., 51(1): 71-87.
• Kubátová A. & Martínková E. (1999): Mikroskopické houby na lidských mumiích [Micromycetes on human mummies]. – Mykol. Listy, no. 69: 21-25.
• Kubátová A. & Huňková Z. (1998): Culture Collection of Fungi (CCF) in Prague – Accessions and new biochemical data since 1997. – Novit. Bot. Univ. Carol. 12/1998: 41-52.
• Kubátová A. & Martínková E. (1998): Oncocladium flavum and Malbranchea flava - interesting filamentous micromycetes discovered on human mummies. - Remedia - Klin. Mikrobiol. 2(8): 269-272.
• Kubátová A., Váňová M. & Prášil K. (1998): Contribution to the biodiversity of soil microfungi of the Šumava Mts., Czech Republic. – Silva Gabreta 2: 23-34.
• Kubátová A., Váňová M. & Prášil K. (1997): CCF catalogue of filamentous fungi. Ed. 4. - Novit. Bot. Univ. Carol. 10/1996: 5-120.
• Rieger M. & Kubátová A. (1996): Alergologicky významné mikromycety v našem životním prostředí [An allergologically important micromycetes in the environment of the Czech Republic]. - In: Rieger M. [ed.], Alergie - aeroplankton - zeleň, p. 59-69, Čes. ekol. ústav, Praha.
• Kubátová A. (1995): New records of penicillia from the Czech and Slovak Republics: Penicillium coprophilum, P. minioluteum, and P. rubefaciens. - Novit. Bot. Univ. Carol. 8/1993-1994: 7-19.
• Kubátová A. & Prášil K. [eds.] (1995): Současný stav, využití moderních metod a perspektivy studia rodu Penicillium[Present state, modern methods and perspective in Penicillium study]. - 121 p., ČVSM, Praha.
• Kubátová A. (1995): Historie a současný stav studia rodu Penicillium [Study of the genus Penicillium – history and new approaches]. - In: Kubátová A. & Prášil K. [eds.], Současný stav, využití moderních metod a perspektivy studia rodu Penicillium [Present state, modern methods and perspective in Penicillium study], p. 3-14, ed. ČVSM, Praha.
• Kubátová A. (1995): Změny v pojetí a nomenklatuře některých druhů rodu Penicillium[Species concept in some Penicillium species]. - In: Kubátová A. & Prášil K. [eds.], Současný stav, využití moderních metod a perspektivy studia rodu Penicillium [Present state, modern methods and perspective in Penicillium study], p. 18-30, ed. ČVSM, Praha.
• Nováková A. & Kubátová A. (1995): Studium rodu Penicilliumv České a Slovenské republice a přehled druhů uváděných z tohoto území [Study of the genus Penicilliumin Czech and Slovak Republics and survey of reported species]. - In: Kubátová A. & Prášil K. [eds.], Současný stav, využití moderních metod a perspektivy studia rodu Penicillium[ Present state, modern methods and perspective in Penicillium study], p. 31-88, ČVSM, Praha.
• Kubátová A. & Prášil K. (1995): Microfungi from the walls of flats. - Novit. Bot. Univ. Carol. 9/1995: 21-27.
• Kubátová A. & Prášil K. (1995): Ophiostomatální a další mikroskopické houby lesních dřevin s příznaky tracheomykózního onemocnění. Předběžné výsledky. [Ophiostomatoid and other microfungi on the forest tree species with tracheomycotic symptoms. Preliminary results.]. - In: Čížková D. et Švecová M. [eds.], Sborník referátů (II) z odborného semináře Aktuální problémy ochrany dřevin [Proceedings of the workshop (II) Present problems of trees protection], p. 18 - 37, PřF UK, Praha.
• Kubátová A. (1994): New records of micromycetes from Czech and Slovak Republics. III. Acremonium furcatum, Gonatobotryum parasiticum, Stachybotrys bisbyi, and Wardomyces inflatus. - Czech Mycol. 47(2): 151-158.
• Kubátová A. (1993): New records of micromycetes from Czechoslovakia. II. Filobasidiella depauperata (Petch) Samson, Stalpers et Weijman. - Česká Mykol. 46(1-2)/1992: 126-130.
• Kubátová A.(1992): New records of micromycetes from Czechoslovakia. I. - Česká Mykol. 45(4)/1991: 155-163.
• Kubátová A. (1991): Findings of a rare speciesPenicillium atramentosum Thom in Czechoslovakia and Poland. - Novit. Bot. Univ. Carol. 6/1990: 33-38.
•  Kubátová A. (1991): Nálezy pyrenomycetů Sphaerodes fimicola a S.retispora var. inferior  (Ascomycetes, Sordariales) v Československu. - Česká Mykol. 45(3): 85-89.
• Fassatiová O., Kubátová A., Prášil K. & Váňová M. (1991): Catalogue of strains. Ed. 3. - 100 p., Praha.
• Kubátová A. (1990): Eladia saccula (Dale) G.Smith, nový mikromycet pro Československo [Eladia saccula (Dale) G.Smith, a new micromycete for Czechoslovakia]. - Česká Mykol. 44(1): 20-25.
• Fassatiová O. & Kubátová A. (1990): Evaluation of the diagnostic features of some species of Penicillium section Divaricatum. - In: Samson R.A. & Pitt J.I. [eds.], Modern concepts in Penicillium and Aspergillus classification, p. 149-157, Plenum Press, New York et London.
• Fassatiová O., Kubátová A., Prášil K. & Váňová M. (1987): Mikroskopické houby v archivním prostředí [Microscopical fungi in archive environment]. - Česká Mykol. 41: 8-15.
• Kubátová A. (1987): Microscopic fungi in the phylloplane of some wood species. - Novit. Bot. Univ. Carol. 3/1987: 9-23.

Abstrakty článků

GRANTY A ZÁMĚRY

• GA ČR: Adaptace netopýrů na plísňové onemocnění geomykózu. 2012-15. Člen týmu (hl. řeš. Dr. N. Martínková, ÚBO AV ČR)
• MZe: Národní program konzervace a využití genofondu mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu. 2012-2016. Spoluřešitel.
• MZe: Národní program konzervace a využití genofondu mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu. 2009-2011. Spoluřešitel.
• FRVŠ: Multimediální výukový atlas zygomycetů. 2009. Hl. řešitel.
• MZe: Národní program konzervace a využití genofondu mikroorganismů a drobných sživočichů hospodářského významu. 2006-2008. Spoluřešitel.
• FRVŠ: Multimediální fotoatlas mikroskopických hub pro zkvalitnění výuky mykologie. 2006. Hl. řešitel.
• MŠMT: Ekologické procesy v evoluci modelových skupin organismů. 2005-2010. Spoluřešitel (hl. řeš. doc. P. Volf)
• MŽP: Ekologická rozhraní: interakce živého a neživého v povrchových ekosystémech půd a antropogenních substrátů. 2005-2007. Spoluřešitel (hl řeš. Z. Soldán)
• IGA MZ ČR: Rychlá detekce a epidemiologie nozokomiální invazivní aspergilózy. 2003-05. Spoluřešitel (hl. řeš. P.Hamal)
• FRVŠ: Aplikace multimediálních prostředků v bakalářské výuce botaniky. 2003. Spoluřešitel (hl. řeš. K. Prášil)
• GA ČR: Ekologie a fylogeneze rodu Geosmithia a jeho vztah ke kůrovci S. intricatus. 2002-04. Spoluřešitel (hl. řeš. Dr. S. Pažoutová, MBÚ AV ČR)
• MŠMT: Rozmanitost organismů, jejich struktur a interakci z ekologického a evolučního hlediska (Biodiverzita vybraných skupin bezcévných rostlin). 1999-2003. Spoluřešitel (hl. řeš. prof. V. Kořínek)
• GA ČR: Agregační feromon bělokaza dubového (Scolytus intricatus) a možnosti jeho využití k ochraně dubových porostů. 1997-99. Spoluřešitel. (hl. řeš. Dr. Koutek, ÚOCHAB)
• GA AV: Glykosidázy u hub a jejich biochemické a taxonomické zhodnocení. .1996-98. Spoluřešitel. (hl. řeš. Dr. Z. Huňková, MBÚ AV ČR)
• FRVŠ Min. škol.: Kurs moderních metod v taxonomii a diagnostice mikroorganismů. 1996. Spoluřešitel.(hl. řeš. doc. P. Pikálek)
• GA UK: Vývoj metody pro stanovení mikromycetů v aspirabilní frakci prašného aerosolu. 1995-97. Spoluřešitel. (hl. řeš. doc. M. Braniš)
• Global Environmental Foundation: Centra biodiverzity v biosférické rezervaci Šumava. 1994-95. Spoluřešitel. (hl. řeš. prof. J. Váňa)
• GA ČR: Biotické interakce při osidlování toxických substrátů vegetací. 1993-95. Spoluřešitel. (hl. řeš. doc. P. Kovář)
• Fond dynamického rozvoje: Biodiverzita přírodních ekosystémů Šumavy. 1993-94. Spoluřešitel. (hl. řeš. prof. J. Váňa)
• GA UK: Stanovení vláknitých mikroskopických hub ve vybraných potravinách (druhové zastoupení, ekologie, zdravotní závadnost). 1993. Spoluřešitel. (hl. řeš. Dr. M. Váňová)
• Min. zeměd.: Hromadné odumírání dubů, smrků a dalších dřevin v lesních porostech s příznaky tracheomykózního onemocnění. 1991-1995. Spoluřešitel. (hl. řeš. Dr. F. Soukup, VÚLHM, řeš. na kat. bot. K. Prášil)

KONFERENCE, WORKSHOPY A STÁŽE

• 2014: Micromyco 2014, Praha (workshop ČVSM)
• 2013: 3. Česko-slovenská vědecká mykologická konference, Olomouc
• 2011: 2. Česko-slovenská vědecká mykologická konference, Smolenice
• 2010: Micromyco 2010, České Budějovice (workshop ČVSM)
• 2009: Česko-slovenská vědecká mykologická konference, Brno
• 2009: Aktuální problémy potravinářské mikrobiologie, Třešť
• 2009: Život v půdě X, České Budějovice
• 2008: Micromyco 2008, České Budějovice (workshop ČVSM)
• 2008: Život v pôde IX, Bratislava
• 2008: Mikrobiologie potravin, Liblice (seminář ČSSM)
• 2007: Houby a antropogenní prostředí, Praha (konference ČVSM)
• 2007: Micromyco 2007, České Budějovice (workshop ČVSM)
• 2007: 4. česko-slovenská mezioborová konference lékařské mykologie, Pardubice
• 2006: Geoekologické problémy Krkonoš, Svoboda n. Úpou
• 2005: Houby a dřeviny, Praha (seminář ČVSM)
• 2005: Život v pôde VI, Praha (mezinárodní seminář)
• 2004: Mykologický průzkum v chráněných územích ČR, Praha (organizace a účast na semináři ČVSM)
• 2001: Mykologický výzkum na Šumavě, Praha (odborná prac. konference)
• 2000: Aktuální problematika mikrobiologie potravin, Liblice (konference ČSSM)
• 2000: 2. česko-slovenská mezioborová konference lékařské mykologie, Pardubice
• 1998: Problematika anamorfního rodu Fusarium, Praha (čs. seminář ČVSM)
• 1997, 2 týdny, Holandsko, Baarn, mezinárodní workshop o peniciliích a studijní pobyt ve sbírce mikromycetů CBS (Centraalbureau voor Schimmelcultures)
• 1994: Současný stav, využití moderních metod a perspektivy studia rodu Penicillium, Praha  (čs. seminář ČVSM)
• 1989, 2 týdny, Maďarsko, Budapest, mezinárodní kurs UNESCO: Training Course and Seminar on the Role and Services of Culture Collections in Biotechnology
• 1985, 2 týdny, Polsko, Varšava, Varšavská universita, Suwalský národní park

PROFESNÍ ORGANIZACE A REDAKČNÍ RADY

• Česká vědecká společnost pro mykologii (člen knihovní komise)
• Česko-slovenská společnost mikrobiologická
• Czech Mycology (člen redakční rady)

Osobní zájmy

• Pohledy na vrcholky hor

• Pohledy na mikroskopické houby zblízka