7. 11. 2017

Procházka mitochondriálním transkriptomem silenky obecné

RNDr. Helena Štorchová, CSc. 

(Laboratoř reprodukce rostlin, Ústav experimentální botaniky AV ČR)

Rostlinné a živočišné mitochondriální genomy se dramaticky liší. Zatímco mitochondriální DNA živočichů je poměrně krátka, má ustálený počet genů a konzervativní promotor, nacházíme u rostlin ohromující proměnlivost ve velikosti a uspořádání mitochondriálního genomu. Téměř u všech vyšších  rostlin dochází také ke změnám uspořádání mitochondriálního genomu v rámci jedince , a to cestou intramolekulární rekombinace. Ta se nevyhýbá ani kódujícím oblastem a někdy vede ke vzniku chimér – genů, poskládaných z kousků jiných genů. Ty se mohou přepisovat a překládat, chimerické proteiny mohou interferovat s mitochondriální funkcí.  Někdy dochází ke specifickému ovlivnění vývinu rostlin – ztrátě schopnosti produkovat životaschopný pyl. Tento jev se nazývá cytoplazmatická pylová sterilita (CMS). Byla zkoumána již v předminulém století, a to nikým menším než Charlesem Darwinem. Avšak teprve rozmach molekulární biologie umožnil odhalit její genetické pozadí. Dosud jsme však teprve na počátku chápání složitých interakcí mezi mitochondrií a jádrem, které CMS doprovázejí. V naší laboratoři se věnujeme analýze globálního transkriptomu mitochondrie i jádra s cílem nalézt geny, které se na ustavení CMS podílejí. Naší modelovou rostlinou se stala silenka obecná, která vyniká extravagancí přestaveb mitochondriálního genomu i v rámci velmi proměnlivého rodu Silene.

CV přednášející ZDE.

Související publikace:

• Non-coding RNA may be associated with cytoplasmic male sterility in Silene vulgaris
• The application of RNA‑seq to the comprehensive analysis of plant mitochondrial transcriptomes
• High transcript abundance, RNA editing, and small RNAs in intergenic regions within the massive mitochondrial genome of the angiosperm Silene noctiflora

Pozvánka ke stažení ZDE.