Doktorské studium biomedicíny

Charakteristika oboru

Biologie parazitických prvoků, helmintů a členovců na úrovni organismů buněk a molekul a jejich interakcí s hostiteli. Mechanismy patogenity, funkční morfologie a biochemie parazitů, mechanismy účinku antiparazitárních léčiv a vzniku rezistence. Biologie a ekologie přenašečů infekčních nemocí a jejich interakcí s patogény.

Nabídka přednášek, kurzů a seminářů

Buněčné a molekulární interakce mezi parazitem a hostitelem (Kulda, Horák)
Biologie parazitických prvoků (Tachezy)
Biologie parazitických prvoků - cvičení (Kulda)
Biologie helmnitů (Horák)
Biologie helmintů - cvičení (Mikeš)
Lékařská entomologie (Volf)
Lékařská entomologie - cvičení (Votýpka)
Imunologie parazitárních nákaz (Kopecký)
Parazitologické laboratorní techniky (Hrdý)
Molekulární biologie parazitů (Tachezy)
Biochemie parazitů (Hrdý)
Molekulární taxonomie (Flegr)
Patologie parazitárních nákaz (Koudela)
Epidemiologie parazitárních nákaz (Kodym)
Diagnostika a terapie parazitárních nákaz (Nohýnková)
Computational genomics (týdenní kurs) (VanRanst, Tachezy)

Výzkumná témata řešená na pracovišti a nabídka témat dizertací

A. Buněčná biologie, molekulární biologie a metabolické dráhy parazitických prvoků. Funkce a biogeneze hydrogenosomů a mitosomů. Regulace transkripce genů pro hydrogenosomální proteiny. Hydrogenosomálné ferredoxiny a flavoproteiny. Biogeneze Fe-S center u anaerobních prvoků. Molekulární a biochemické základy rezistence k antiparazitárním léčivům. Buněčný cyklus patogenních prvoků.
B. Molekulární fylogenetika parazitických prvoků. Molekulární epidemiologie a vnitrodruhová diverzita parazitických prvoků. Fylogenetické vztahy parazitů skupin Metamonada, Parabasala, Apicomplexa a Microspora.
C. Eto-parazitologie. Vliv parazitů na chování hostitele.
D. Infekce parazitickými prvoky. Oportunní infekce protisty u člověka (amphizoické améby, Cryptosporidium, kokcidie, Microspora); Infekce Toxoplasma gondii u člověka a zvířat (imunomodulace, buněčná a humorální imunitní odpověď). Infekce bezobratlých mikrosporidiemi. Biochemické aspekty vztahu mezi parazitem a hostitelem u vybraných skupin protist (Trichomonadida, Diplomonadida, amphizoické améby, Microspora).
E. Infekce parazitickými helminty. Biologie evropských schistosom. Vzájemné vztahy mezi parazitem a hostitelem při infekcích mezihostitelských plžů trematody. Únikové strategie motolic v různých fázích vývojového cyklu. Vývoj a alergogenní účinek cerkárií trematodů v nespecifickém hostiteli. Biochemické faktory uplatňující se při průniku motolic kůží a jejich migraci v hostiteli.
F. Funční morfologie a ultrastruktura parazitů. Cytoskeletální systémy a cytokineze parazitických bičíkovců. Ultrastruktura mikrosporidií.
G. Členovci jako přenašeči infekčních mikroorganismů. Faktory ovlivňující vývoj leishmanií ve flebotomech. Enzymatické a antigenní vlastnosti slin flebotomů. Antimikrobiální aktivity ve střevě flebotomů. Trypanosomy ptáků a jejich přenašeči. Ekologie klíšťat a jejich role v epidemiologii a epizootologii nemocí.

Další informace o školitelích a námětech disertačních prací lze nalézt na adrese:
http://www.kav.cas.cz/pdsb/OR13/

Požadavky oborové rady na publikační činnost doktorandů

1) povinné publikace před odevzdáním disertační práce (klasická forma disertace) - specifikovat
Podmínkou jsou minimálně dvě původní vědecké práce v oboru parazitologie, publikované nebo přijaté k publikaci v impaktovaných, mezinárodně uznávaných vědeckých časopisech. Případné výjimky (např. započtení vynikajícího rukopisu zaslaného k publikaci) podléhají schválení oborovou radou
Práce připravené, zaslané nebo přijaté k tisku mohou být použity je-li dizertace předkládána formou rukopisu, a to buď začleněné do textu ve formě kapitol nebo jako přílohy k textu dizertace

2) počet publikací (v případě odevzdání monotematického souboru publikací k obhajobě) a případné další požadavky na tyto publikace (např. typ časopisu)
Je-li dizertace předkládána formou souboru publikací, musí obsahovat nejméně tři publikované práce, případně práce definitivně přijaté k publikaci, nikoliv rukopisy připravované nebo zaslané k publikaci (zákon a na něm postavený studijní řád nepřipouští výjimku).
Doplnění povinného počtu publikací dalšími rukopisy je však přípustné

Oborová rada