Charakteristika oboru

Organická chemie se zabývá isolací, syntézou a určováním struktury organických sloučenin a studiem vztahů mezi strukturou a vlastnostmi organických látek s využitím chemických i fyzikálních metod.

Výzkumná témata řešená na pracovišti

• Vývoj nových reakcí založených na využití sloučenin přechodných kovů s důrazem na jejich aplikaci v organické syntéze pro přípravu nových potenciálně biologicky aktivních látek (prof. RNDr. Martin Kotora, CSc., orgchem.cz/kotora).
• Difunkční a polyfunkční reaktivní karbonylové sloučeniny jako stavební bloky pro samoskladbu dynamických polymerů a makrocyklů. (Ing. Dušan Drahoňovský, PhD)
• Syntézy regioselektivně substituovaných derivátů cyklodextrinů a jejich aplikace v analytické chemii, biochemii, farmakologii a materiálové chemii (doc. RNDr. Jindřich Jindřich, CSc., jindrich.org).
• Molekulární elektronika. Příprava látek pro konstrukci rovinných molekulových mříží. Jedná se o kobaltové cyklobutadien-cyklopentadienové komplexy a také o substituované lanthanové sendvičové komplexy porfyrinu a ftalokyaninu. Tyto komplexy budou následně propojeny rigidními molekulárními můstky za vzniku 2-D molekulární mříže (RNDr. Jaroslav Pecka).
• Studium fytoremediace jako metody dekontaminace životního prostředí od organických ekopolutantů (Ke studovaným látkám patří především chlorované fenoly, mošusové látky či estrogeny z perorálních kontraceptiv). Biotransformace organických sloučenin v tkáňových kulturách vyšších rostlin. Příprava radioaktivně značených sloučenin (doc. Ing. Stanislav Smrček, CSc.
• Syntetická, bioorganická a medicinální chemie složek nukleových kyselin. Syntézy modifikovaných nukleobází, nukleosidů, nukleotidů a oligonukleotidů, studium jejich biologické aktivity a aplikací v bioanalýze a chemické biologii (Doc. Ing. Michal Hocek, CSc. DSc.)
• Studium elementárních kroků v organických a organokovových reakcích pomocí metod hmotnostní spektrometrie, iontové spektroskopie a kvantové chemie. Cílem je prohlubování celkového porozumění reakčním mechanismům a formulování nových obecných konceptů v organické a organokovové reaktivitě. Doc. Jana Roithová, PhD
• Vývoj nových syntetických metod pro přípravu enantiomerně čistých látek za využití katalýzy malými organickými molekulami. Příprava nových organických katalyzátorů a jejich ověření při využití v  organické syntéze (RNDr. Jan Veselý, PhD).
• Syntézy amino-, halogen-, thio- a dalších derivátů sacharidů. Příprava biologicky významných oligosacharidů a glykopeptidů a studium jejich vlastností Syntézy porfyrinových receptorů modifikovaných glykosylovanými steroidy. (prof. RNDr. Tomáš Trnka, CSc.).

Nabídka přednášek, kurzů a seminářů na katedře organické chemie

• C270P03 Struktura a reaktivita I (doc. RNDr. Robert Ponec, CSc.)
• C270P06A Spektrální metody IČ, MS (RNDr. Martin Štícha, RNDr. Stanislav Hilgard, CSc.)
• C270P06B Spektrální metody NMR I (RNDr. Martin Dračinský, Ph.D.)
• C270P08A Pokročilé metody NMR (RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.)
• C270P09 Spektrální metody NMR II (RNDr. Martin Dračinský, Ph.D.)
• C270P13A Organická syntéza I ( RNDr.Jan Veselý, Ph.D.)
• C270P13B Organická syntéza II I ( RNDr.Jan Veselý, Ph.D.)
• C270P16 Výpočetní chemie pro experimentální chemiky (Doc. RNDr. Jana Roithová, Ph.D.)
• C270P20 Vybrané kapitoly z org. chemie (prof. RNDr. Miloslav Černý, DrSc.)
• C270P22 Chemie léčiv (doc. Ing. Stanislav Smrček, CSc.)
• C270P24  Alkaloidy I (doc. Ing. Josef Hájíček, CSc.)
• C270P31 Struktura a reaktivita II (RNDr. Ivo Starý, CSc.)
• C270P69 Supramolekulární chemie (RNDr. Jindřich Jindřich, CSc.)
• C270P74 Moderní metody v organické syntéze (Prof. RNDr. Pavel Kočovský, CSc.)
• C270P77 Základy spektroskopie molekul (Doc. RNDr. Jana Roithová, Ph.D.)
• C270P04    Sacharidy   (Prof. RNDr. Tomáš Trnka, CSc)

Požadavky oborové rady na publikační činnost doktorandů

1) povinné publikace před odevzdáním disertační práce (klasická forma disertace) - specifikovat
Minimálně 2 ve slušném časopise IF>1, běžnější jsou 3 i více
2) počet publikací (v případě odevzdání monotematického souboru publikací k obhajobě) a případné další požadavky na tyto publikace (např. typ časopisu) 
minimálně 5 publikací publikovaných ve slušném časopise IF >1

Oborová rada